RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548092.5

TRAFD1-204, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAFD1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-204ENST00000548092 SASS6Q6UVJ0 657 aa4.96□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 EP400NLQ6ZTU2 488 aa4.96□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 ASB15Q8WXK1 588 aa4.96□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 DLG3Q92796 817 aa4.96□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 BTBD2Q9BX70 525 aa4.96□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 C22orf23Q9BZE7 217 aa4.96□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM39BQ9GZU3 492 aa4.96□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa4.96□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 KALRNO60229 2985 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 UQCRHLA0A096LP55 91 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 EPOPA6NHQ4 379 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 SLPIP03973 132 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 UQCRHP07919 91 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 CLTBP09497 229 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 HMOX1P09601 288 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 CR2P20023 1033 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 ACVRL1P37023 503 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 RAC3P60763 192 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 TLE2Q04725 743 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 TRIM68Q6AZZ1 485 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 TTLL5Q6EMB2 1281 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 BRAPQ7Z569 592 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 HSCBQ8IWL3 235 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 ZFPM1Q8IX07 1006 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 CERS5Q8N5B7 392 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 CFHR4Q92496 578 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 LPAR1Q92633 364 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 ADOQ96SZ5 270 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 POLR3GLQ9BT43 218 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 VPS11Q9H270 941 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 TLR9Q9NR96 1032 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 DLL3Q9NYJ7 618 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 OAZ3Q9UMX2 235 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 CFAP46Q8IYW2 2715 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM221A6NGB7 291 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 GOLGA6L22H0YM25 854 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 M0R296 226 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 EFCAB14O75071 495 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 BCAR3O75815 825 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 CYP2B6P20813 491 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 MSNP26038 577 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 VCPP55072 806 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 PCOLCEQ15113 449 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 ZMAT1Q5H9K5 638 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 TAF3Q5VWG9 929 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 IGSF22Q8N9C0 903 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 MYRIPQ8NFW9 859 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 SCYL1Q96KG9 808 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 SORCS2Q96PQ0 1159 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 COA1Q9GZY4 146 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 OR10A5Q9H207 317 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 SEMA4AQ9H3S1 761 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 PANK3Q9H999 370 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 TRIM39Q9HCM9 518 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 MUTYHQ9UIF7 546 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 ITPR3Q14573 2671 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 CXCL11O14625 94 aa4.93□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 ARHGAP6O43182 974 aa4.93□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 CDC14BO60729 498 aa4.93□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 SLC5A1P13866 664 aa4.93□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 MYL6BP14649 208 aa4.93□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 COMTP21964 271 aa4.93□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 STAT5BP51692 787 aa4.93□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 NFYCQ13952 458 aa4.93□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM132BQ14DG7 1078 aa4.93□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 CATSPEREQ5SY80 951 aa4.93□□□□□ -1.62
TRAFD1-204ENST00000548092 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms