RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.61
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CTDSP2-203ENST00000547701 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CTDSP2-203ENST00000547701 SIX4Q9UIU6 781 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDSP2-203ENST00000547701 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CTDSP2-203ENST00000547701 SPDYE4A6NLX3 237 aa25.1■■□□□ 1.61
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CTDSP2-203ENST00000547701 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
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CTDSP2-203ENST00000547701 CYB561D2O14569 222 aa25.08■■□□□ 1.61
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CTDSP2-203ENST00000547701 ZCWPW2Q504Y3 356 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM86AQ8N2M4 240 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDSP2-203ENST00000547701 OR5B17Q8NGF7 314 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC7A14Q8TBB6 771 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDSP2-203ENST00000547701 PARD3BQ8TEW8 1205 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDSP2-203ENST00000547701 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
CTDSP2-203ENST00000547701 FNBP1Q96RU3 617 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDSP2-203ENST00000547701 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
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CTDSP2-203ENST00000547701 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
CTDSP2-203ENST00000547701 C2CD4DB7Z1M9 353 aa25.07■■□□□ 1.6
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CTDSP2-203ENST00000547701 GPR37L1O60883 481 aa25.07■■□□□ 1.6
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CTDSP2-203ENST00000547701 TNNC2P02585 160 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDSP2-203ENST00000547701 ELF1P32519 619 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDSP2-203ENST00000547701 PNOCQ13519 176 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDSP2-203ENST00000547701 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa25.07■■□□□ 1.6
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CTDSP2-203ENST00000547701 TMC2Q8TDI7 906 aa25.06■■□□□ 1.6
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CTDSP2-203ENST00000547701 EPHX3Q9H6B9 360 aa25.06■■□□□ 1.6
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CTDSP2-203ENST00000547701 GABRDO14764 452 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDSP2-203ENST00000547701 IKBKBO14920 756 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDSP2-203ENST00000547701 MICAL2O94851 1124 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDSP2-203ENST00000547701 SEC24AO95486 1093 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDSP2-203ENST00000547701 VNN2O95498 520 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDSP2-203ENST00000547701 THEM5Q8N1Q8 247 aa25.05■■□□□ 1.6
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CTDSP2-203ENST00000547701 WSCD1Q658N2 575 aa25.04■■□□□ 1.6
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CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF516Q92618 1163 aa25.04■■□□□ 1.6
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CTDSP2-203ENST00000547701 CPB1P15086 417 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDSP2-203ENST00000547701 ATICP31939 592 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDSP2-203ENST00000547701 PTPN21Q16825 1174 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDSP2-203ENST00000547701 FOXR2Q6PJQ5 311 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDSP2-203ENST00000547701 PDCL2Q8N4E4 241 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDSP2-203ENST00000547701 OR10T2Q8NGX3 314 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDSP2-203ENST00000547701 PLEKHO2Q8TD55 490 aa25.03■■□□□ 1.6
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