RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 TTC14Q96N46 770 aa8.71□□□□□ -1.01
LMO3-212ENST00000535535 CEP89Q96ST8 783 aa8.71□□□□□ -1.01
LMO3-212ENST00000535535 HOXC10Q9NYD6 342 aa8.71□□□□□ -1.01
LMO3-212ENST00000535535 FLRT1Q9NZU1 646 aa8.71□□□□□ -1.01
LMO3-212ENST00000535535 LRP2BPQ9P2M1 347 aa8.71□□□□□ -1.01
LMO3-212ENST00000535535 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
LMO3-212ENST00000535535 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
LMO3-212ENST00000535535 PTPRCP08575 1304 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 XIRP2A4UGR9 3374 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 FSD2A1L4K1 749 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 CPP00450 1065 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 ITGB3P05106 788 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 ASNSP08243 561 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 FGRP09769 529 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 STAT5AP42229 794 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 RWDD2BP57060 319 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 PPP2R5AQ15172 486 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 CR1LQ2VPA4 569 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 SDE2Q6IQ49 451 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 EFCAB13Q8IY85 973 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 CCDC34Q96HJ3 373 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 FEZ1Q99689 392 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 MAFFQ9ULX9 164 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 MYH8P13535 1937 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 CHD7Q9P2D1 2997 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 TRANK1O15050 2925 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 C19orf81C9J6K1 198 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 PRC1O43663 620 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 FAM163BP0C2L3 166 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 LTBRP36941 435 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 FAM26FQ5R3K3 315 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 MFSD14CQ5VZR4 134 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 PAF1Q8N7H5 531 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 USP38Q8NB14 1042 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 BADQ92934 168 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 IL17RAQ96F46 866 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 TMEM169Q96HH4 297 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 CDHR1Q96JP9 859 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 CCDC140Q96MF4 163 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 DNAJC18Q9H819 358 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 COMMD8Q9NX08 183 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 LZTS1Q9Y250 596 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 E2F6O75461 281 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 CNMDO75829 334 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 DDAH1O94760 285 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 HOXC6P09630 235 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 CYBAP13498 195 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 LCP1P13796 627 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 PLA2G5P39877 138 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 IL15P40933 162 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 FXNQ16595 210 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 ALDH1L2Q3SY69 923 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 STK32CQ86UX6 486 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 TRPV1Q8NER1 839 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 TAF4BQ92750 862 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 UIMC1Q96RL1 719 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 UNC45AQ9H3U1 944 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 CASS4Q9NQ75 786 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 PI4KBQ9UBF8 816 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 RSPH14Q9UHP6 348 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 SLC15A5A6NIM6 579 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 H7BY64 318 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 KIAA0754O94854 1291 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 BAG4O95429 457 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 CNGA1P29973 690 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 CYP2C19P33261 490 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 TIMM10P62072 90 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 GSTO1P78417 241 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 ADAM9Q13443 819 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 GRB14Q14449 540 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 KRT72Q14CN4 511 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 TRIM60Q495X7 471 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 EMC4Q5J8M3 183 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 MCTP2Q6DN12 878 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 HDAC7Q8WUI4 952 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-212ENST00000535535 TRIM7Q9C029 511 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms