RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533252.1

CASP4-211, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 3

Gene CASP4, Length 215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-211ENST00000533252 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa5.93□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 MROH6A6NGR9 719 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 APAF1O14727 1248 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 ERC2O15083 957 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 ANP32CO43423 234 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 PEX14O75381 377 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 UBXN7O94888 489 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 AMY1AP04745 511 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 FPR1P21462 350 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 GPTP24298 496 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 ECHS1P30084 290 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 PTPN7P35236 360 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 SREBF1P36956 1147 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 WASP42768 502 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 MAP2K6P52564 334 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 USP14P54578 494 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 GNAI1P63096 354 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 TNIP1Q15025 636 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 MST1LQ2TV78 715 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 COBLL1Q53SF7 1204 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 CCDC157Q569K6 752 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 REXO1L1PQ8IX06 675 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 DRC7Q8IY82 874 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 SYNE4Q8N205 404 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 RELTQ969Z4 430 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 TMX3Q96JJ7 454 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 NT5C1BQ96P26 610 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 DMRTA2Q96SC8 542 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 GPHA2Q96T91 129 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 PTPN18Q99952 460 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 STK31Q9BXU1 1019 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 C1orf112Q9NSG2 853 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 TDP1Q9NUW8 608 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 GPRC5DQ9NZD1 345 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 STAP2Q9UGK3 403 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 TRPS1Q9UHF7 1281 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 HACL1Q9UJ83 578 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 NR2E1Q9Y466 385 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 NR2E3Q9Y5X4 410 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 RNF123Q5XPI4 1314 aa5.92□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 ZNF831Q5JPB2 1677 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 SHANK3Q9BYB0 1731 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 TAF1LQ8IZX4 1826 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 DTNBO60941 627 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 ITGA10O75578 1167 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 FTLP02792 175 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 HOXB7P09629 217 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 ADCY7P51828 1080 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 HGFACQ04756 655 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 NEXNQ0ZGT2 675 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 GBX1Q14549 363 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 C19orf54Q5BKX5 351 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 FAM26FQ5R3K3 315 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 NT5DC1Q5TFE4 455 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 IL31Q6EBC2 164 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 NPNTQ6UXI9 565 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 COPS6Q7L5N1 327 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 RSPH3Q86UC2 560 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 DENND1CQ8IV53 801 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 POU5F2Q8N7G0 328 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 FAM156AQ8NDB6 213 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 OR5M3Q8NGP4 307 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 PLBD2Q8NHP8 589 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 ZNF480Q8WV37 535 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 RGMAQ96B86 450 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 CRAMP1Q96RY5 1269 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 PLEKHF1Q96S99 279 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 EYA3Q99504 573 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 APOL5Q9BWW9 433 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 B3GNT5Q9BYG0 378 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 ACTL7AQ9Y615 435 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 UBR3Q6ZT12 1888 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 C4AP0C0L4 1744 aa5.91□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 FAM171A2A8MVW0 826 aa5.9□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 ARHGAP6O43182 974 aa5.9□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 PAX4O43316 350 aa5.9□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 B3GALT2O43825 422 aa5.9□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 B4GALT3O60512 393 aa5.9□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 PHF2O75151 1096 aa5.9□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 TUSC2O75896 110 aa5.9□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 STC2O76061 302 aa5.9□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 DDNO94850 711 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 MYL1P05976 194 aa5.9□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 MYL3P08590 195 aa5.9□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 HTR1BP28222 390 aa5.9□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 PCSK1P29120 753 aa5.9□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 NEK3P51956 506 aa5.9□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CASP4-211ENST00000533252 ADAM8P78325 824 aa5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms