RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 ACRBPQ8NEB7 543 aa11.17□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 DBF4BQ8NFT6 615 aa11.17□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa11.17□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 GAD1Q99259 594 aa11.17□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 AGPAT1Q99943 283 aa11.17□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
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TRPS1-210ENST00000519815 TBX21Q9UL17 535 aa11.17□□□□□ -0.62
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TRPS1-210ENST00000519815 FAM228BP0C875 321 aa11.16□□□□□ -0.62
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TRPS1-210ENST00000519815 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF132P52740 706 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 CDH8P55286 799 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 CDR2Q01850 454 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 KIF5AQ12840 1032 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 GRIK3Q13003 919 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 TAF3Q5VWG9 929 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 DEFB128Q7Z7B8 93 aa11.14□□□□□ -0.63
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