RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 XAGE2Q96GT9 111 aa2.22□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 VN1R3Q9BXE9 311 aa2.22□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 ADAM19Q9H013 955 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMX1Q9H3N1 280 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 SEMA3GQ9NS98 782 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 GTSE1Q9NYZ3 720 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 FBXO3Q9UK99 471 aa2.22□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
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RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF197O14709 1029 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHADO15335 359 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 CYP26A1O43174 497 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 LRRTM2O43300 516 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 CTIFO43310 598 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
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RNU6-548P-201ENST00000517083 CHMP4CQ96CF2 233 aa2.21□□□□□ -2.06
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RNU6-548P-201ENST00000517083 DEPDC7Q96QD5 511 aa2.21□□□□□ -2.06
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RNU6-548P-201ENST00000517083 TRPS1Q9UHF7 1281 aa2.21□□□□□ -2.06
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