RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515707.1

ABCC3-217, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ABCC3, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3-217ENST00000515707 PSMD2Q13200 908 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 UBALD2Q8IYN6 164 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 FAM84AQ96KN4 292 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 DSEQ9UL01 958 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 ZNF318Q5VUA4 2279 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 PTPRJQ12913 1337 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 LRG1P02750 347 aa21.79■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 RPN1P04843 607 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 TMEM191BP0C7N4 346 aa21.79■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 PRR29P0C7W0 189 aa21.79■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 ADCY1Q08828 1119 aa21.79■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 STK4Q13043 487 aa21.79■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 MYBPC2Q14324 1141 aa21.79■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 SURF1Q15526 300 aa21.79■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa21.79■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 KRBA2Q6ZNG9 492 aa21.79■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 LRRC52Q8N7C0 313 aa21.79■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 XXYLT1Q8NBI6 393 aa21.79■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 CXorf38Q8TB03 319 aa21.79■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 GOLGA5Q8TBA6 731 aa21.79■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa21.79■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa21.79■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 TMEM221A6NGB7 291 aa21.78■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 KPNA7A9QM74 516 aa21.78■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 M0R296 226 aa21.78■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 CYB561D2O14569 222 aa21.78■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 CLIC2O15247 247 aa21.78■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 OR4Q2P0C623 313 aa21.78■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 COL9A1P20849 921 aa21.78■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 HFE2Q6ZVN8 426 aa21.78■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 WDR49Q8IV35 697 aa21.78■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa21.78■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 INTS13Q9NVM9 706 aa21.78■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 SIX4Q9UIU6 781 aa21.78■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 AGAP1Q9UPQ3 857 aa21.78■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 ZNF202O95125 648 aa21.77■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 VNN2O95498 520 aa21.77■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 TNNC2P02585 160 aa21.77■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 CYP24A1Q07973 514 aa21.77■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 DPYDQ12882 1025 aa21.77■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 METTL23Q86XA0 190 aa21.77■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 OR5B17Q8NGF7 314 aa21.77■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 OR10T2Q8NGX3 314 aa21.77■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 ASIC4Q96FT7 647 aa21.77■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 BORCS6Q96GS4 357 aa21.77■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.77■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 KCNK12Q9HB15 430 aa21.77■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21.77■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ABCC3-217ENST00000515707 MUC6Q6W4X9 2439 aa21.76■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.76■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 RHOBTB3O94955 611 aa21.76■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 KRT19P08727 400 aa21.76■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 LAMP2P13473 410 aa21.76■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 RBP5P82980 135 aa21.76■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 BFSP1Q12934 665 aa21.76■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 GPR17Q13304 367 aa21.76■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 PSMD6Q15008 389 aa21.76■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 DUOXA2Q1HG44 320 aa21.76■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 WSCD1Q658N2 575 aa21.76■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 KMT2EQ8IZD2 1858 aa21.76■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa21.76■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.76■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 CGRRF1Q99675 332 aa21.76■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 SMOC2Q9H3U7 446 aa21.76■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 CDH7Q9ULB5 785 aa21.76■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 YIPF1Q9Y548 306 aa21.76■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 RHOP08100 348 aa21.75■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 TDGQ13569 410 aa21.75■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa21.75■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 ELMOD1Q8N336 334 aa21.75■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 RDH13Q8NBN7 331 aa21.75■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 ITFG1Q8TB96 612 aa21.75■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 FGF13Q92913 245 aa21.75■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 NXPE3Q969Y0 559 aa21.75■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 TMEM209Q96SK2 561 aa21.75■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 RTP3Q9BQQ7 232 aa21.75■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 KCTD10Q9H3F6 313 aa21.75■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa21.75■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 MTMR11A4FU01 709 aa21.74■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 EXOC3O60645 756 aa21.74■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 DLATP10515 647 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 TWF1Q12792 350 aa21.74■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 HTR4Q13639 388 aa21.74■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 SLC5A9Q2M3M2 681 aa21.74■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 NPAS3Q8IXF0 933 aa21.74■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 THEM5Q8N1Q8 247 aa21.74■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 TMEM174Q8WUU8 243 aa21.74■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 FNBP1Q96RU3 617 aa21.74■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa21.74■■□□□ 1.07
ABCC3-217ENST00000515707 CRISPLD1Q9H336 500 aa21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms