RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FLCNQ8NFG4 579 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SAAL1Q96ER3 474 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BORCS6Q96GS4 357 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CORO1BQ9BR76 489 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CEP72Q9P209 647 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANK1P16157 1881 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRBA1A5PL33 1030 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KPNA7A9QM74 516 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYB561D2O14569 222 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP18.18■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PNPLA4P41247 253 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EPHA5P54756 1037 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASIC1P78348 528 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TWF1Q12792 350 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLD1Q13393 1074 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RESP18Q5W5W9 173 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CENPPQ6IPU0 288 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 METTL23Q86XA0 190 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF507Q8TCN5 953 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPR152Q8TDT2 470 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MCRS1Q96EZ8 462 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CBWD1Q9BRT8 395 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ECI2O75521 394 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VNN2O95498 520 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR4Q2P0C623 313 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPC5P78333 572 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMARCB1Q12824 385 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DUSP4Q13115 394 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SV2CQ496J9 727 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UNC13DQ70J99 1090 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 THEM5Q8N1Q8 247 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPD1LQ8N335 351 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ING5Q8WYH8 240 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCIF1Q9H4Z3 704 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIAA1586Q9HCI6 787 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 YIPF1Q9Y548 306 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CACNA1HO95180 2353 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCN1AP35498 2009 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PI15O43692 258 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ALDH1A3P47895 512 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EPHB3P54753 998 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WNT7BP56706 349 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EHHADHQ08426 723 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SURF1Q15526 300 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM26FQ5R3K3 315 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GLIS3Q8NEA6 775 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HPS3Q969F9 1004 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF560Q96MR9 790 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PGLYRP2Q96PD5 576 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPR88Q9GZN0 384 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASAH2Q9NR71 780 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASB3Q9Y575 518 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MTMR11A4FU01 709 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GOLGA8IPA6NC78 632 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF233A6NK53 670 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GOLGA8JA6NMD2 632 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STK25O00506 426 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CEBPBP17676 345 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HOXD13P35453 343 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCR2P41597 374 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TUFMP49411 452 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PFKPQ01813 784 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POTEHQ6S545 545 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRC52Q8N7C0 313 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C1orf127Q8N9H9 656 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATAD1Q8NBU5 361 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR10T2Q8NGX3 314 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ELSPBP1Q96BH3 223 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCEAL4Q96EI5 215 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SHDQ96IW2 340 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CRISPLD1Q9H336 500 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDE11AQ9HCR9 933 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGEF3Q9NR81 526 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ITGA11Q9UKX5 1188 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CA14Q9ULX7 337 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AGAP1Q9UPQ3 857 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ITGB3P05106 788 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLFN14P0C7P3 912 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STARD6P59095 220 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBP5P82980 135 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WSCD1Q658N2 575 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CEP57L1Q8IYX8 460 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HS6ST3Q8IZP7 471 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms