RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511481.5

SEC24D-211, Transcript of SEC24 homolog D, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEC24D, Length 2,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24D-211ENST00000511481 ARHGEF10O15013 1369 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 HIP1O00291 1037 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 A1BGP04217 495 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 NFICP08651 508 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 PDHBP11177 359 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 WASP42768 502 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 SYKP43405 635 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 MAP2K6P52564 334 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 TNK2Q07912 1038 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 CDK5R2Q13319 367 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 PDCLQ13371 301 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 IDI1Q13907 227 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 KRT32Q14532 448 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 MPEG1Q2M385 716 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 CEP85LQ5SZL2 805 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 CDPF1Q6NVV7 123 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 C22orf34Q6ZV56 151 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 C7orf31Q8N865 590 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 DUSP23Q9BVJ7 150 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 MAGEH1Q9H213 219 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 EPB41L1Q9H4G0 881 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 C19orf44Q9H6X5 657 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 DSEQ9UL01 958 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 ATP23Q9Y6H3 246 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 KIF20BQ96Q89 1820 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 MROH1Q8NDA8 1641 aa5.97□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 AREL1O15033 823 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 TEX33O43247 280 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 RASSF9O75901 435 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 CHGBP05060 677 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 SYPP08247 313 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 RPSAP08865 295 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 CMA1P23946 247 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 GRIK3Q13003 919 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 TUSC3Q13454 348 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 PRKG1Q13976 671 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 E2F5Q15329 346 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 CCDC40Q4G0X9 1142 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 WDR45BQ5MNZ6 344 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 RASGRP2Q7LDG7 609 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 LYSMD2Q8IV50 215 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 OXR1Q8N573 874 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 USHBP1Q8N6Y0 703 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 COG3Q96JB2 828 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 RMDN3Q96TC7 470 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 SH3GL2Q99962 352 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 CD244Q9BZW8 370 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 POLD4Q9HCU8 107 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 PNPLA8Q9NP80 782 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 GJB4Q9NTQ9 266 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa5.96□□□□□ -1.45
SEC24D-211ENST00000511481 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 SRGAP2O75044 1071 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 PAPLNO95428 1278 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 YEATS4O95619 227 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 CYP21A2P08686 494 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 FDPSP14324 419 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 FPR2P25090 351 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 PREPP48147 710 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 LGALS4P56470 323 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 DSC2Q02487 901 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 NAA25Q14CX7 972 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 POSTNQ15063 836 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 GGT6Q6P531 493 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 NRG4Q8WWG1 115 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 BTBD6Q96KE9 485 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 PANX2Q96RD6 677 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 SLC40A1Q9NP59 571 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 HDAC6Q9UBN7 1215 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 TMX2Q9Y320 296 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 NUMBLQ9Y6R0 609 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 X6R8D5 127 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 MED23Q9ULK4 1368 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 ABCC6O95255 1503 aa5.96□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 A0A1B0GUA9 196 aa5.95□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 TMCO5BA8MYB1 307 aa5.95□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 FOXN1O15353 648 aa5.95□□□□□ -1.46
SEC24D-211ENST00000511481 NPHS1O60500 1241 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms