RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 NDUFA13Q9P0J0 144 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 PHTF1Q9UMS5 762 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 CHMP2BQ9UQN3 213 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 EFR3BQ9Y2G0 817 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 PARP3Q9Y6F1 533 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 LRP5O75197 1615 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 ELP1O95163 1332 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A1B0GTH6 734 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 ACOD1A6NK06 481 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 STMND1H3BQB6 276 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 H3BQV1 296 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 GOLGA8MH3BSY2 632 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 KMOO15229 486 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 NOL3O60936 208 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM127O75204 238 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 KLHL18O94889 574 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 HLA-DRAP01903 254 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 F11P03951 625 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 CTRB1P17538 263 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 CDH3P22223 829 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 PRKACBP22694 351 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 CFL1P23528 166 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 DNAJB1P25685 340 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 MSX1P28360 303 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 TUFMP49411 452 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 CASP7P55210 303 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 NOP14P78316 857 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 PTPAQ15257 358 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 PRR16Q569H4 304 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 BORAQ6PGQ7 559 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 ANKS3Q6ZW76 656 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM124AQ86V42 546 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 VPS36Q86VN1 386 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 LILRB4Q8NHJ6 448 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 DDI1Q8WTU0 396 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 LMBR1Q8WVP7 490 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 TTC17Q96AE7 1141 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 C19orf60Q96EN9 201 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 VPS50Q96JG6 964 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 PIGSQ96S52 555 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 TM9SF3Q9HD45 589 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 KLHL11Q9NVR0 708 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 FBXO40Q9UH90 709 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 ANAPC5Q9UJX4 755 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 GJD2Q9UKL4 321 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 BCORQ6W2J9 1755 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 HEG1Q9ULI3 1381 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 NDUFS8O00217 210 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 KRIT1O00522 736 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 FGF18O76093 207 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 HSPA4LO95757 839 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 APOEP02649 317 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 POLR2MP0CAP2 368 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 ATP4AP20648 1035 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 GRIK1P39086 918 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 CD97P48960 835 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 CSNK2BP67870 215 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 KRT85P78386 507 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 SULT2A1Q06520 285 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 CDC16Q13042 620 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 CUL2Q13617 745 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 PRKG1Q13976 671 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 COTL1Q14019 142 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 GIT2Q14161 759 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 KRT24Q2M2I5 525 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 XKR3Q5GH77 459 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 SNX30Q5VWJ9 437 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 RAB12Q6IQ22 244 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 TTBK2Q6IQ55 1244 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 CD302Q8IX05 232 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 TTC5Q8N0Z6 440 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 ATL1Q8WXF7 558 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 HERVK_113Q902F9 699 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 TIFAQ96CG3 184 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 OPTNQ96CV9 577 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 C7orf34Q96L11 122 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 DNAJC7Q99615 494 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 C2orf40Q9H1Z8 148 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF408Q9H9D4 720 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms