RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 DLATP10515 647 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ATP1A3P13637 1013 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 GRNP28799 593 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 GTF2H1P32780 548 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 CASP4P49662 377 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ACOT2P49753 483 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 MXI1P50539 228 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 COPB1P53618 953 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 CCL23P55773 120 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 UBASH3AP57075 661 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 FANCCQ00597 558 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 MYL7Q01449 175 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.732e-11■■□□□ 12.4
CTPS1-211ENST00000497210 MBTPS1Q14703 1052 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 VWA3BQ502W6 1294 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 MFSD5Q6N075 450 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 WDR49Q8IV35 697 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 C7orf61Q8IZ16 206 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 SCLYQ96I15 445 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 CGRRF1Q99675 332 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ADAM2Q99965 735 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 HSD3B7Q9H2F3 369 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ASB7Q9H672 318 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 TAB2Q9NYJ8 693 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 IPPQ9Y573 584 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 A0A0U1RQF3 1178 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 P4HA2O15460 535 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 RECQL4O94761 1208 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 BAIAP3O94812 1187 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 CLSTN1O94985 981 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 TNNC2P02585 160 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM191BP0C7N4 346 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 CXCL8P10145 99 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ITGA4P13612 1032 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 TNNI1P19237 187 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 OSTNP61366 133 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 IKBKEQ14164 716 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 DSC3Q14574 896 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM132DQ14C87 1099 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 DBN1Q16643 649 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 FIGNL1Q6PIW4 674 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 SLC24A5Q71RS6 500 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ABI1Q8IZP0 508 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC150Q8NCX0 1101 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 SLC35C1Q96A29 364 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC127Q96BQ5 260 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 IQCDQ96DY2 449 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 SNX27Q96L92 541 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 MFSD14AQ96MC6 490 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 IMPG2Q9BZV3 1241 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 HAPLN2Q9GZV7 340 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 NDST4Q9H3R1 872 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 RGS18Q9NS28 235 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 IFNKQ9P0W0 207 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 USP20Q9Y2K6 914 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 GIT1Q9Y2X7 761 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 DERAQ9Y315 318 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 C2CD2Q9Y426 696 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 MICAL3Q7RTP6 2002 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 UMODL1Q5DID0 1318 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF623O75123 536 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 EOMESO95936 686 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 TPM1P09493 284 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 FAM157BP0CG42 384 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 UBXN1Q04323 297 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 FPGSQ05932 587 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 BIRC3Q13489 604 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 TRIM14Q14142 442 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 UBXN11Q5T124 520 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 KRT39Q6A163 491 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 GLB1LQ6UWU2 654 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 DEFB128Q7Z7B8 93 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 IRF2BP1Q8IU81 584 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 CEP120Q8N960 986 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 DBF4BQ8NFT6 615 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 URGCPQ8TCY9 931 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 PARD3BQ8TEW8 1205 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 PIK3R5Q8WYR1 880 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 APOL6Q9BWW8 343 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-211ENST00000497210 VPS16Q9H269 839 aa10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms