RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495517.5

RBM41-208, Transcript of RNA binding motif protein 41, human

TSL 2

Gene RBM41, Length 3,315 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM41-208	ENST00000495517	C1QTNF8	P60827	252 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	FAM228A	Q86W67	206 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	RNF149	Q8NC42	400 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	ASGR1	P07306	291 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	ZNF286B	P0CG31	522 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	CDR2	Q01850	454 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	SMARCB1	Q12824	385 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	HACE1	Q8IYU2	909 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	C7orf31	Q8N865	590 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	WDR24	Q96S15	920 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	SIX4	Q9UIU6	781 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	TBX21	Q9UL17	535 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	GBF1	Q92538	1859 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	TMEM150B	A6NC51	233 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	CTNNA2	P26232	953 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	STX17	P56962	302 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	AMPD2	Q01433	879 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	BFSP2	Q13515	415 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	CUL2	Q13617	745 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	ITGA7	Q13683	1181 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	ARMC3	Q5W041	872 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	RNF135	Q8IUD6	432 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	PGBD4	Q96DM1	585 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	SCN5A	Q14524	2016 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	TTC3	P53804	2025 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517		C9IYK1	514 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	EPHB6	O15197	1021 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	CYP2B6	P20813	491 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	KRT9	P35527	623 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	RABGGTA	Q92696	567 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	EXOC4	Q96A65	974 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	NT5C1B	Q96P26	610 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517		A0A087WZ62	844 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	LRRC53	A6NM62	1247 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	STAG3L1	P0CL83	205 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	P4HA1	P13674	534 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	CHRNB2	P17787	502 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	GRIK3	Q13003	919 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	LPIN1	Q14693	890 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	GPNMB	Q14956	572 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	TAZ	Q16635	292 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	SEMA4D	Q92854	862 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	VPS16	Q9H269	839 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	IL37	Q9NZH6	218 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	DSE	Q9UL01	958 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	RTN2	O75298	545 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	CILP	O75339	1184 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM41-208	ENST00000495517	SGPL1	O95470	568 aa		7.37	□□□□□ -1.23

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