RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489850.5

NOM1-208, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-208ENST00000489850 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.08■■□□□ 1.13
NOM1-208ENST00000489850 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.08■■□□□ 1.13
NOM1-208ENST00000489850 SIX4Q9UIU6 781 aa22.08■■□□□ 1.13
NOM1-208ENST00000489850 IKBKBO14920 756 aa22.07■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 CETN3O15182 167 aa22.07■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 ADAM12O43184 909 aa22.07■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 KRT13P13646 458 aa22.07■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 CASP4P49662 377 aa22.07■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 ROR1Q01973 937 aa22.07■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 MORC3Q14149 939 aa22.07■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 CAMK4Q16566 473 aa22.07■■□□□ 1.12
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NOM1-208ENST00000489850 CCDC149Q6ZUS6 474 aa22.07■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.07■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 SPATA18Q8TC71 538 aa22.07■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 APOL5Q9BWW9 433 aa22.07■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.07■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.07■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 HUS1O60921 280 aa22.06■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 AKAP3O75969 853 aa22.06■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 ABLIM3O94929 683 aa22.06■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 PAPLNO95428 1278 aa22.06■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 SPATA31D3P0C874 917 aa22.06■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 BFSP1Q12934 665 aa22.06■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 TMC5Q6UXY8 1006 aa22.06■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa22.06■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 GPR149Q86SP6 731 aa22.06■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.06■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.06■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.06■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 BORCS6Q96GS4 357 aa22.06■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 HPDLQ96IR7 371 aa22.06■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 TTC28Q96AY4 2481 aa22.06■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 PHACTR2O75167 634 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 ZMYND10O75800 440 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 CPB1P15086 417 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 ATF2P15336 505 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 CCNE1P24864 410 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 HOXA9P31269 272 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 ELF1P32519 619 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 TRPC3Q13507 836 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 ISM2Q6H9L7 571 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 SCN1AP35498 2009 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 PLXNA3P51805 1871 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 BICDL2A1A5D9 508 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 WDR27A2RRH5 827 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 BIN1O00499 593 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 C8AP07357 584 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 ATICP31939 592 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 VAMP7P51809 220 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 ARPP19P56211 112 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 BIRC3Q13489 604 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 PPM1LQ5SGD2 360 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 WSCD1Q658N2 575 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 DPH6Q7L8W6 267 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 FAM84AQ96KN4 292 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 RFPL2O75678 378 aa22.03■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 POU2F2P09086 479 aa22.03■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 BMP6P22004 513 aa22.03■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 ZP2Q05996 745 aa22.03■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.03■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 TCEAL8Q8IYN2 117 aa22.03■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.03■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.03■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 ZNF516Q92618 1163 aa22.03■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 PRKD2Q9BZL6 878 aa22.03■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 NR2E1Q9Y466 385 aa22.03■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 NCOR1O75376 2440 aa22.02■■□□□ 1.12
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NOM1-208ENST00000489850 PRRG1O14668 218 aa22.02■■□□□ 1.12
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NOM1-208ENST00000489850 GTF2H1P32780 548 aa22.02■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 LHX1P48742 406 aa22.02■■□□□ 1.12
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NOM1-208ENST00000489850 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.02■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 PIDD1Q9HB75 910 aa22.02■■□□□ 1.12
NOM1-208ENST00000489850 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NOM1-208ENST00000489850 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.01■■□□□ 1.11
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