RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485407.1

NHLRC3-205, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene NHLRC3, Length 623 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-205ENST00000485407 BTKQ06187 659 aa6.3□□□□□ -1.4
NHLRC3-205ENST00000485407 KLRC3Q07444 240 aa6.3□□□□□ -1.4
NHLRC3-205ENST00000485407 LSAMPQ13449 338 aa6.3□□□□□ -1.4
NHLRC3-205ENST00000485407 SEMA5AQ13591 1074 aa6.3□□□□□ -1.4
NHLRC3-205ENST00000485407 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
NHLRC3-205ENST00000485407 KRT32Q14532 448 aa6.3□□□□□ -1.4
NHLRC3-205ENST00000485407 COG2Q14746 738 aa6.3□□□□□ -1.4
NHLRC3-205ENST00000485407 KIF22Q14807 665 aa6.3□□□□□ -1.4
NHLRC3-205ENST00000485407 FAM110CQ1W6H9 321 aa6.3□□□□□ -1.4
NHLRC3-205ENST00000485407 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
NHLRC3-205ENST00000485407 TREML2Q5T2D2 321 aa6.3□□□□□ -1.4
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NHLRC3-205ENST00000485407 MVB12AQ96EY5 273 aa6.3□□□□□ -1.4
NHLRC3-205ENST00000485407 MMP19Q99542 508 aa6.3□□□□□ -1.4
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NHLRC3-205ENST00000485407 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.3□□□□□ -1.4
NHLRC3-205ENST00000485407 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.3□□□□□ -1.4
NHLRC3-205ENST00000485407 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.3□□□□□ -1.4
NHLRC3-205ENST00000485407 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.3□□□□□ -1.4
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NHLRC3-205ENST00000485407 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.3□□□□□ -1.4
NHLRC3-205ENST00000485407 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
NHLRC3-205ENST00000485407 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
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NHLRC3-205ENST00000485407 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.29□□□□□ -1.4
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NHLRC3-205ENST00000485407 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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NHLRC3-205ENST00000485407 NDUFB10O96000 172 aa6.28□□□□□ -1.4
NHLRC3-205ENST00000485407 NFICP08651 508 aa6.28□□□□□ -1.4
NHLRC3-205ENST00000485407 FAM163BP0C2L3 166 aa6.28□□□□□ -1.4
NHLRC3-205ENST00000485407 SNHG28P0DPA3 235 aa6.28□□□□□ -1.4
NHLRC3-205ENST00000485407 CYP2C8P10632 490 aa6.28□□□□□ -1.4
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NHLRC3-205ENST00000485407 BMP3P12645 472 aa6.28□□□□□ -1.4
NHLRC3-205ENST00000485407 ENPP1P22413 925 aa6.28□□□□□ -1.4
NHLRC3-205ENST00000485407 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
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