RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	FSD2	A1L4K1	749 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	VNN1	O95497	513 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	NDUFV1	P49821	464 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	WSCD1	Q658N2	575 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	PALB2	Q86YC2	1186 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	SLC35C1	Q96A29	364 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22	3e-6	■■■■■ 178.9
RBM34-208	ENST00000485019	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	MTRR	Q9UBK8	725 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	ANK1	P16157	1881 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	LINC01565	O15544	149 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	GLUD1	P00367	558 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	CYP11A1	P05108	521 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	P4HA1	P13674	534 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	OR1D2	P34982	312 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	FMO5	P49326	533 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	MYL7	Q01449	175 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	MYL5	Q02045	173 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	CETN1	Q12798	172 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	KCNH2	Q12809	1159 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	CBWD6	Q4V339	395 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	WDR44	Q5JSH3	913 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	DPH6	Q7L8W6	267 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	EFHB	Q8N7U6	833 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	TAF4B	Q92750	862 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	CASP10	Q92851	521 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	RAB20	Q9NX57	234 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	L1RE1	Q9UN81	338 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	POLI	Q9UNA4	740 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	OR6C75	A6NL08	312 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	KCNJ18	B7U540	433 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	ADAM12	O43184	909 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	OAZ2	O95190	189 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	CPB1	P15086	417 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	EPCAM	P16422	314 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	CLCN4	P51793	760 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	ADAM15	Q13444	863 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	KCNJ12	Q14500	433 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	SEMA4D	Q92854	862 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	SNX25	Q9H3E2	840 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	FANCL	Q9NW38	375 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	DPP7	Q9UHL4	492 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	TRIP11	Q15643	1979 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	SMTNL1	A8MU46	457 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	BECN2	A8MW95	431 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	TGM5	O43548	720 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	TBC1D4	O60343	1298 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	TPM2	P07951	284 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	OR4Q2	P0C623	313 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	SPATA31D3	P0C874	917 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	ELF1	P32519	619 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	LHX1	P48742	406 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF165	P49910	485 aa		13.66	□□□□□ -0.22

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