RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 GPR158Q5T848 1215 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD45Q5TZF3 282 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 PGBD4Q96DM1 585 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 SOX7Q9BT81 388 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 BRIP1Q9BX63 1249 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 GPR87Q9BY21 358 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 EPC1Q9H2F5 836 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 DCTPP1Q9H773 170 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 CNNM1Q9NRU3 951 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 CEP72Q9P209 647 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 SPEF2Q9C093 1822 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 H0YIN7 160 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 NRP1O14786 923 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 MTSS1O43312 755 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 IPO13O94829 963 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 FKBP9O95302 570 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 ADH4P08319 380 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 GAAP10253 952 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 GNAT2P19087 354 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 ADCYAP1R1P41586 468 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 RPS8P62241 208 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 PHC1P78364 1004 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 TFCP2Q12800 502 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 SPIDRQ14159 915 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 FKBP9P1Q75LS8 142 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 ATG9AQ7Z3C6 839 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 SMC5Q8IY18 1101 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 UNC5BQ8IZJ1 945 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF610Q8N9Z0 462 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 MPHOSPH8Q99549 860 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 MS4A5Q9H3V2 200 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 MMRN2Q9H8L6 949 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 SPON1Q9HCB6 807 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 ING3Q9NXR8 418 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 NRXN2Q9P2S2 1712 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 EYA2O00167 538 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 KDM1AO60341 852 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 NRP2O60462 931 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 ALDH1A2O94788 518 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 PFKMP08237 780 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 SRGNP10124 158 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 MAKP20794 623 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 KCNA3P22001 575 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 HSD3B2P26439 372 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 NRG3P56975 720 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 TIMM10P62072 90 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 PPARAQ07869 468 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 GRAPQ13588 217 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 TERF2Q15554 542 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 CRY2Q49AN0 593 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 METTL24Q5JXM2 366 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 TSHZ3Q63HK5 1081 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 PIK3C3Q8NEB9 887 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 GAB3Q8WWW8 586 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 CACNA1SQ13698 1873 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 ENPP3O14638 875 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 NPR1P16066 1061 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 ADORA1P30542 326 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 IL15P40933 162 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 TGFB2P61812 414 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 NUCB1Q02818 461 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 CHRNDQ07001 517 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 CD69Q07108 199 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 FRMD7Q6ZUT3 714 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 AACSQ86V21 672 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 CHD1LQ86WJ1 897 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 OR5M3Q8NGP4 307 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 USP7Q93009 1102 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 GCC1Q96CN9 775 aa5.71□□□□□ -1.5
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