RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482083.7

RNF13-213, Transcript of ring finger protein 13, human

TSL 5

Gene RNF13, Length 777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF13-213	ENST00000482083	TP73	O15350	636 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	GPR39	O43194	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	TTLL1	O95922	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	PRR35	P0CG20	571 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	TUBA4A	P68366	448 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	RFK	Q969G6	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	TDP1	Q9NUW8	608 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	KEL	P23276	732 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	CERS1	P27544	350 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	NPTX2	P47972	431 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	MC2R	Q01718	297 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	RAB39A	Q14964	217 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083		A0A0B4J269	797 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	MOSPD3	O75425	235 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	DRD4	P21917	467 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	CCT8	P50990	548 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	TUBB3	Q13509	450 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	BMP15	O95972	392 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	CD1A	P06126	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	MASP1	P48740	699 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	TRIB1	Q96RU8	372 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	SMO	Q99835	787 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RNF13-213	ENST00000482083		E9PLN8	166 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	TRIAP1	O43715	76 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	JTB	O76095	146 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	NR2F6	P10588	404 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	PROSER3	Q2NL68	480 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	CEP85	Q6P2H3	762 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	SOAT2	O75908	522 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	RHO	P08100	348 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	HSD3B2	P26439	372 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	PCSK6	P29122	969 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	EPHB2	P29323	1055 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	SLC16A1	P53985	500 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	TLE1	Q04724	770 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	PPM1N	Q8N819	430 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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