RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478932.1

USP25-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP25, Length 2,605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-208ENST00000478932 PSMC4P43686 418 aa4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 NOMO3P69849 1222 aa4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 CAP1Q01518 475 aa4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 ENPEPQ07075 957 aa4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 MAMLD1Q13495 774 aa4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 XP32Q5T750 250 aa4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 CYP4F22Q6NT55 531 aa4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 CATSPER4Q7RTX7 472 aa4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 WDTC1Q8N5D0 677 aa4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 CXorf38Q8TB03 319 aa4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 USP6NLQ92738 828 aa4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 ACAP3Q96P50 834 aa4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 APOL6Q9BWW8 343 aa4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 TRIM31Q9BZY9 425 aa4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 CARD9Q9H257 536 aa4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 ADAMTS10Q9H324 1103 aa4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 ERVK-5Q9HDB9 667 aa4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 HMGXB4Q9UGU5 601 aa4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 AGAP1Q9UPQ3 857 aa4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 CNTN6Q9UQ52 1028 aa4.4□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 MROH7Q68CQ1 1323 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 MGAMO43451 1857 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 SCN1AP35498 2009 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 H3BQF6 201 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 TTI1O43156 1089 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 MCF2P10911 925 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 FLT3LGP49771 235 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 AP3M2P53677 418 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 HADHBP55084 474 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 INHBEP58166 350 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 FAM193AP78312 1265 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 CENPCQ03188 943 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 TRIM32Q13049 653 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 MFSD10Q14728 455 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 FAM187BQ17R55 369 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 ZNF667Q5HYK9 610 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 CYP4A22Q5TCH4 519 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 C11orf63Q6NUN7 778 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 MON1BQ7L1V2 547 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 RASGEF1CQ8N431 466 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 C12orf29Q8N999 325 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 TRPV1Q8NER1 839 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 CD101Q93033 1021 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 CCDC102AQ96A19 550 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 HPDLQ96IR7 371 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 FAM81BQ96LP2 452 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 TWNKQ96RR1 684 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 ADPGKQ9BRR6 497 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 AP5M1Q9H0R1 490 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 SDCBP2Q9H190 292 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 SMYD3Q9H7B4 428 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 SNTG2Q9NY99 539 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 KLK14Q9P0G3 267 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 UVRAGQ9P2Y5 699 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 TJP2Q9UDY2 1190 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 GABRQQ9UN88 632 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 RRN3P2A6NIE6 340 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 PIK3R2O00459 728 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 CES2O00748 559 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 PPEF2O14830 753 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 DAPK3O43293 454 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 ATP8B1O43520 1251 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 NPTXRO95502 500 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 SLC10A3P09131 477 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 DARSP14868 501 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 TCF4P15884 667 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 MMP8P22894 467 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 RGS2P41220 211 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 SSR1P43307 286 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 KCNJ1P48048 391 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 ZNF132P52740 706 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 RAD23BP54727 409 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 TNNC1P63316 161 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 ADAM17P78536 824 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 PURAQ00577 322 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 TMEM132DQ14C87 1099 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 SURF1Q15526 300 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 ZNF677Q86XU0 584 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 IFT20Q8IY31 132 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 UBL4BQ8N7F7 174 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 C7orf31Q8N865 590 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 TRIB2Q92519 343 aa4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
USP25-208ENST00000478932 C18orf8Q96DM3 657 aa4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms