RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478196.6

RPS27A-208, Transcript of ribosomal protein S27a, human

TSL 2

Gene RPS27A, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS27A-208	ENST00000478196	SHTN1	A0MZ66	631 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	ECE2	O60344	883 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	PDE8B	O95263	885 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	HK1	P19367	917 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	KIR2DL3	P43628	341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	RGS3	P49796	1198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	SLC6A3	Q01959	620 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	NIM1K	Q8IY84	436 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	NELL1	Q92832	810 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	DYDC2	Q96IM9	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	EYA3	Q99504	573 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	SIL1	Q9H173	461 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	CD209	Q9NNX6	404 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	PCNT	O95613	3336 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	DOCK2	Q92608	1830 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	PSMD14	O00487	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	EFCAB14	O75071	495 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	PRL	P01236	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	IL1R1	P14778	569 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	ADORA1	P30542	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	EPS15	P42566	896 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	GYG1	P46976	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	AVPR1B	P47901	424 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	FNTB	P49356	437 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	TIMM10	P62072	90 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	IRF9	Q00978	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	TFCP2	Q12800	502 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	METTL24	Q5JXM2	366 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	DACT2	Q5SW24	774 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	GPC2	Q8N158	579 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	CERS5	Q8N5B7	392 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	MAML3	Q96JK9	1138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	TINF2	Q9BSI4	451 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	MXD3	Q9BW11	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	COA1	Q9GZY4	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	KCNH6	Q9H252	994 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	MYH7	P12883	1935 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RPS27A-208	ENST00000478196	PDPK1	O15530	556 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	MTSS1	O43312	755 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	NPTXR	O95502	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	LCORL	Q8N3X6	602 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	LPIN2	Q92539	896 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	DPF2	Q92785	391 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	EXOC2	Q96KP1	924 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196		A0A1B0GUL7	405 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	STC2	O76061	302 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS27A-208	ENST00000478196	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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