RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475330.1

CBX1P5-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 5, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P5, Length 559 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P5-201ENST00000475330 RBP3P10745 1247 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 GPR3P46089 330 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 BCAR1P56945 870 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 IL13RA1P78552 427 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 UGT8Q16880 541 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 CT83Q5H943 113 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 BMP2KLQ5H9B9 411 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 EPHA10Q5JZY3 1008 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 SKAP1Q86WV1 359 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 STPG3Q8N7X2 389 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 FAM122AQ96E09 287 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 KAZALD1Q96I82 304 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 CROTQ9UKG9 612 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 DNAH12Q6ZR08 3092 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 FRMPD3Q5JV73 1810 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 MAST2Q6P0Q8 1798 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 E2F8A0AVK6 867 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 MAFGO15525 162 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 XPOTO43592 962 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 CYP7B1O75881 506 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 IL18BPO95998 194 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 HMGCRP04035 888 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 GLDCP23378 1020 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 RAB27AP51159 221 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 SHHQ15465 462 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 C9orf50Q5SZB4 431 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 ANKRD45Q5TZF3 282 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 FAM151AQ8WW52 585 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 TRIB2Q92519 343 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 TEKT1Q969V4 418 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 MRIQ9BWK5 157 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 MTG2Q9H4K7 406 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 KCND1Q9NSA2 647 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 EDARQ9UNE0 448 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 MYO9BQ13459 2157 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P5-201ENST00000475330 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 AKAP10O43572 662 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 PCDH8O95206 1070 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 KRT85P78386 507 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 TCP10Q12799 353 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 MAP3K12Q12852 859 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 NFATC3Q12968 1075 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 UBE4AQ14139 1066 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 RTP5Q14D33 572 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 ACAP2Q15057 778 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 PPP2R5AQ15172 486 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 STILQ15468 1287 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 TREML2Q5T2D2 321 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 KANK2Q63ZY3 851 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 COA7Q96BR5 231 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 SUCLG2Q96I99 432 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 RAX2Q96IS3 184 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 LRRCC1Q9C099 1032 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 CDH23Q9H251 3354 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 DOCK2Q92608 1830 aa6.57□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CBX1P5-201ENST00000475330 RLFQ13129 1914 aa6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms