RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474945.1

SPCS1-204, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPCS1, Length 981 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-204ENST00000474945 YIPF1Q9Y548 306 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.72□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 ZNF318Q5VUA4 2279 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 CYB561D2O14569 222 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 ITGB3P05106 788 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 CFHP08603 1231 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 TMEM191BP0C7N4 346 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 RFX1P22670 979 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 PLD1Q13393 1074 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 CUL4BQ13620 913 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 SLC5A9Q2M3M2 681 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 IQCEQ6IPM2 695 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 METTL23Q86XA0 190 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 EXOC1Q9NV70 894 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 HSPBP1Q9NZL4 362 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 KMT2EQ8IZD2 1858 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-204ENST00000474945 DOCK8Q8NF50 2099 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 A0A1B0GVL5 298 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 KRT19P08727 400 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 SLFN14P0C7P3 912 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 SRFP11831 508 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 CEBPBP17676 345 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 PNPLA4P41247 253 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 CYP2J2P51589 502 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 BFSP1Q12934 665 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 MYBPC2Q14324 1141 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 MTSS1LQ765P7 747 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 CBWD2Q8IUF1 395 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 SIX5Q8N196 739 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 PIP4P2Q8N4L2 257 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 C1orf127Q8N9H9 656 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 FLCNQ8NFG4 579 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 OR10T2Q8NGX3 314 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 NXPE3Q969Y0 559 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 TMEM209Q96SK2 561 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 PDE11AQ9HCR9 933 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 SLC39A2Q9NP94 309 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 ASAH2Q9NR71 780 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 MAFFQ9ULX9 164 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 MTMR11A4FU01 709 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 KPNA7A9QM74 516 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 ANHXE9PGG2 379 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 CYP11A1P05108 521 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 MYL4P12829 197 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 PTPN2P17706 415 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 HOXD13P35453 343 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 GPR17Q13304 367 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 SLC39A12Q504Y0 691 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 CYP4A22Q5TCH4 519 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 WSCD1Q658N2 575 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 PARM1Q6UWI2 310 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 SLC44A3Q8N4M1 653 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 FGF14Q92915 247 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 KXD1Q9BQD3 176 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 KCNH6Q9H252 994 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 CA14Q9ULX7 337 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 ZNF233A6NK53 670 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 CLIC2O15247 247 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 VNN2O95498 520 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 TNNC2P02585 160 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 CMA1P23946 247 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 SYKP43405 635 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 ALDH1A3P47895 512 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 CDR1P51861 262 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 EHHADHQ08426 723 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 DUSP4Q13115 394 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 IER5LQ5T953 404 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 THEM5Q8N1Q8 247 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 TTC9BQ8N6N2 239 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 LRRC52Q8N7C0 313 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 FSIP1Q8NA03 581 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 PRSS33Q8NF86 280 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 ZNF507Q8TCN5 953 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 GPR152Q8TDT2 470 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 TCEAL4Q96EI5 215 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-204ENST00000474945 MCRS1Q96EZ8 462 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms