RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469271.1

NOM1-203, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 1,209 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-203ENST00000469271 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.08■■□□□ 1.13
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NOM1-203ENST00000469271 SIX4Q9UIU6 781 aa22.08■■□□□ 1.13
NOM1-203ENST00000469271 IKBKBO14920 756 aa22.07■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 CETN3O15182 167 aa22.07■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 ADAM12O43184 909 aa22.07■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 KRT13P13646 458 aa22.07■■□□□ 1.12
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NOM1-203ENST00000469271 SPATA18Q8TC71 538 aa22.07■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 APOL5Q9BWW9 433 aa22.07■■□□□ 1.12
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NOM1-203ENST00000469271 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.07■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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NOM1-203ENST00000469271 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa22.06■■□□□ 1.12
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NOM1-203ENST00000469271 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.06■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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NOM1-203ENST00000469271 HPDLQ96IR7 371 aa22.06■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 TTC28Q96AY4 2481 aa22.06■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 PHACTR2O75167 634 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 ZMYND10O75800 440 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
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NOM1-203ENST00000469271 CPB1P15086 417 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 ATF2P15336 505 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 CCNE1P24864 410 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 HOXA9P31269 272 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 ELF1P32519 619 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 TRPC3Q13507 836 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 ISM2Q6H9L7 571 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.05■■□□□ 1.12
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NOM1-203ENST00000469271 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 SCN1AP35498 2009 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 PLXNA3P51805 1871 aa22.05■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.04■■□□□ 1.12
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NOM1-203ENST00000469271 BIN1O00499 593 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 C8AP07357 584 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 ATICP31939 592 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 VAMP7P51809 220 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 ARPP19P56211 112 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 BIRC3Q13489 604 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 PPM1LQ5SGD2 360 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 WSCD1Q658N2 575 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 DPH6Q7L8W6 267 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 FAM84AQ96KN4 292 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.04■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 RFPL2O75678 378 aa22.03■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 POU2F2P09086 479 aa22.03■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 BMP6P22004 513 aa22.03■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 ZP2Q05996 745 aa22.03■■□□□ 1.12
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NOM1-203ENST00000469271 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 TCEAL8Q8IYN2 117 aa22.03■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.03■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.03■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 ZNF516Q92618 1163 aa22.03■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 PRKD2Q9BZL6 878 aa22.03■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 NR2E1Q9Y466 385 aa22.03■■□□□ 1.12
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NOM1-203ENST00000469271 GTF2H1P32780 548 aa22.02■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 LHX1P48742 406 aa22.02■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 SMARCB1Q12824 385 aa22.02■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 GPR17Q13304 367 aa22.02■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.02■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 PIDD1Q9HB75 910 aa22.02■■□□□ 1.12
NOM1-203ENST00000469271 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NOM1-203ENST00000469271 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.01■■□□□ 1.11
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