RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468220.1

CLDN16-203, Transcript of claudin 16, humanhuman

TSL 4

Gene CLDN16, Length 578 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16-203ENST00000468220 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 OBP2AQ9NY56 170 aa7.32□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 CEP72Q9P209 647 aa7.32□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 FBXL5Q9UKA1 691 aa7.32□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 KLK13Q9UKR3 277 aa7.32□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 CFAP45Q9UL16 551 aa7.32□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.32□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 CHD8Q9HCK8 2581 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 DOCK8Q8NF50 2099 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 DCLK1O15075 740 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 RNF40O75150 1001 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 APBB3O95704 486 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 EPHA5P54756 1037 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 IRX4P78413 519 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 PSMD2Q13200 908 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 INF2Q27J81 1249 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 FBXO43Q4G163 708 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 WDR44Q5JSH3 913 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 GPR158Q5T848 1215 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 GALNT17Q6IS24 598 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 Q6ZUG5 572 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 KRT25Q7Z3Z0 450 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 HDDC3Q8N4P3 179 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 NECAB1Q8N987 351 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 APPL2Q8NEU8 664 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 PIGKQ92643 395 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 RSPRY1Q96DX4 576 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 GCNAQ96QF7 691 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 FZD8Q9H461 694 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 PDZD7Q9H5P4 517 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 GKN1Q9NS71 199 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 SLC38A7Q9NVC3 462 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 RCOR1Q9UKL0 485 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 VAV3Q9UKW4 847 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 USP24Q9UPU5 2620 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 INVSQ9Y283 1065 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 PODXLO00592 558 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 MAP3K13O43283 966 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 SLC37A4O43826 429 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 USO1O60763 962 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 SLITRK3O94933 977 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 TPM3P06753 285 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 IFNAR1P17181 557 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 ATP2B1P20020 1258 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 DRD1P21728 446 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 MAPK8P45983 427 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 TNK2Q07912 1038 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 SCRN1Q12765 414 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 RUNX3Q13761 415 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 TAF12Q16514 161 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 FAM187BQ17R55 369 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 TMEM196Q5HYL7 178 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 FSTL4Q6MZW2 842 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 PKN3Q6P5Z2 889 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 SYT13Q7L8C5 426 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 NEK8Q86SG6 692 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 ITIH5Q86UX2 942 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 SLFN12Q8IYM2 578 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 GLIS3Q8NEA6 775 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 CCDC26Q8TAB7 109 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 DEPTORQ8TB45 409 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 BRF1Q92994 677 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 ACDQ96AP0 544 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 CXCL16Q9H2A7 254 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 KCNMB3Q9NPA1 279 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 EBF1Q9UH73 591 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 USP25Q9UHP3 1055 aa7.3□□□□□ -1.24
CLDN16-203ENST00000468220 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms