RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	CDH22	Q9UJ99	828 aa		19.12	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	DSE	Q9UL01	958 aa		19.12	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		19.11	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	KRT13	P13646	458 aa		19.11	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	TYMP	P19971	482 aa		19.11	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	ELF1	P32519	619 aa		19.11	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	19.11	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	ROR1	Q01973	937 aa		19.11	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	ZP2	Q05996	745 aa		19.11	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	BIRC3	Q13489	604 aa		19.11	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	TRPC3	Q13507	836 aa		19.11	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	NFIL3	Q16649	462 aa		19.11	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		19.11	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	ADSSL1	Q8N142	457 aa		19.11	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		19.11	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		19.11	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		19.11	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		19.11	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	HPDL	Q96IR7	371 aa		19.11	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		19.11	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	PIDD1	Q9HB75	910 aa		19.11	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		19.11	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	TSC2	P49815	1807 aa		19.11	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	PRRG1	O14668	218 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	CETN3	O15182	167 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	HUS1	O60921	280 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	AKAP3	O75969	853 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	OAZ2	O95190	189 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	C1R	P00736	705 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	C8A	P07357	584 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	MTHFR	P42898	656 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	MORC3	Q14149	939 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	WSCD1	Q658N2	575 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	ZNF516	Q92618	1163 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		19.1	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	WDR27	A2RRH5	827 aa		19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	OR6C75	A6NL08	312 aa		19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D4	O60343	1298 aa		19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	ZMYND10	O75800	440 aa		19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	OR4Q2	P0C623	313 aa		19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R2	P41236	205 aa		19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	VAMP7	P51809	220 aa		19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	DLG4	P78352	724 aa		19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	CENPP	Q6IPU0	288 aa		19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	GPR149	Q86SP6	731 aa		19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	CXorf38	Q8TB03	319 aa		19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	SUSD6	Q92537	303 aa		19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	BORCS6	Q96GS4	357 aa		19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	POLI	Q9UNA4	740 aa		19.09	■□□□□ 0.65
USP19-210	ENST00000465902	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	19.08	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	CYP11A1	P05108	521 aa		19.08	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	19.08	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	19.08	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	CCNE1	P24864	410 aa		19.08	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	AP3M2	P53677	418 aa		19.08	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	19.08	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		19.08	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	19.08	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		19.08	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	TMC2	Q8TDI7	906 aa		19.08	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		19.08	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	MMS19	Q96T76	1030 aa		19.08	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	19.08	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	19.08	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		19.08	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		19.08	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		19.08	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		19.08	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		19.08	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	MAPK13	O15264	365 aa		19.07	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	CCL16	O15467	120 aa		19.07	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	ABLIM3	O94929	683 aa		19.07	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	COL9A1	P20849	921 aa		19.07	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	BMP6	P22004	513 aa		19.07	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	19.07	■□□□□ 0.64
USP19-210	ENST00000465902	LRRC63	Q05C16	580 aa		19.07	■□□□□ 0.64

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