RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 F8W810 466 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 SPINT1O43278 529 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 LILRA1O75019 489 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 GNA14O95837 355 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 TNNC2P02585 160 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM191BP0C7N4 346 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 OR1G1P47890 313 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC11A1P49279 550 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 BCAR1P56945 870 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 PPP3CAQ08209 521 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 DSC1Q08554 894 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 TUSC3Q13454 348 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 KCNJ12Q14500 433 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 NCAPHQ15003 741 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 SURF1Q15526 300 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 RAB30Q15771 203 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 TCERG1LQ5VWI1 586 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 LUZP1Q86V48 1076 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 BEST2Q8NFU1 509 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 BPIFA3Q9BQP9 254 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 PAAF1Q9BRP4 392 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 MTMR12Q9C0I1 747 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 HSD3B7Q9H2F3 369 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC38A7Q9NVC3 462 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 INTS13Q9NVM9 706 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 DPP3Q9NY33 737 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 FAN1Q9Y2M0 1017 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 DERAQ9Y315 318 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1W2PPC1 479 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 BECN2A8MW95 431 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 NRP1O14786 923 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 PPEF2O14830 753 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 IKBKBO14920 756 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 XPOTO43592 962 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 ALDH2P05091 517 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 ADH1AP07327 375 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 GALTP07902 379 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 KRT19P08727 400 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 LINC00271P0C7V0 271 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 CYP3A5P20815 502 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 GCLMP48507 274 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 CLCNKBP51801 687 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 TAP1Q03518 808 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 LRIT3Q3SXY7 679 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 CDKAL1Q5VV42 579 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 C9orf57Q5W0N0 161 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 KCNT2Q6UVM3 1135 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 WDR49Q8IV35 697 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM114A1Q8IWE2 563 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 C1orf127Q8N9H9 656 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 HASPINQ8TF76 798 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 RSPH1Q8WYR4 309 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF558Q96NG5 402 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 TSPAN18Q96SJ8 248 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM175Q9BSA9 504 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 C17orf80Q9BSJ5 609 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 CERS4Q9HA82 394 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 MTUS1Q9ULD2 1270 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 C2CD2Q9Y426 696 aa9.08□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 VWA8A3KMH1 1905 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 TTLL8A6PVC2 850 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 PODXLO00592 558 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 PHACTR2O75167 634 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 VNN1O95497 513 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 CAVIN2O95810 425 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 CST3P01034 146 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 ITGB3P05106 788 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 ITGB1P05556 798 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 LAG3P18627 525 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 LRPAP1P30533 357 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 CTNNB1P35222 781 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 BMPR1AP36894 532 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 ABL2P42684 1182 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 MARSP56192 900 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 CLDN10P78369 228 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 RELBQ01201 579 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 BIRC3Q13489 604 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 UPP1Q16831 310 aa9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms