RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC5A3P53794 718 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 FOXI1Q12951 378 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 ABCB5Q2M3G0 1257 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC184Q52MB2 194 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 ICE2Q659A1 982 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 SCLT1Q96NL6 688 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 ZSWIM1Q9BR11 485 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 IPPQ9Y573 584 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 DISP3Q9P2K9 1392 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 PCSK5Q92824 1860 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 POMCP01189 267 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 OSMP13725 252 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 TYRP1P17643 537 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 COPB2P35606 906 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 GRM3Q14832 879 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 MINDY4Q4G0A6 757 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 C1orf228Q6PIY5 440 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF354CQ86Y25 554 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 NELL1Q92832 810 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 HERPUD2Q9BSE4 406 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM140Q9NV12 185 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 PTGFRNQ9P2B2 879 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF69Q9UC07 566 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 NOX1Q9Y5S8 564 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 CFTRP13569 1480 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 IFT140Q96RY7 1462 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 FPR1P21462 350 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 MTNR1BP49286 362 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 CLK3P49761 638 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 OCA2Q04671 838 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 MGAT2Q10469 447 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 STK3Q13188 491 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF529Q6P280 563 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 ADGRG3Q86Y34 549 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 LRGUKQ96M69 825 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 SELENOOQ9BVL4 669 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 RNPEPQ9H4A4 650 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 SIK3Q9Y2K2 1263 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A1B0GTW7 788 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 ANO9A1A5B4 782 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 PF4V1P10720 104 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 SCAPQ12770 1279 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 UBXN2BQ14CS0 331 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 SEPT2Q15019 361 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC44A3Q8N4M1 653 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC89Q8N998 374 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 RNF31Q96EP0 1072 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 PHTF1Q9UMS5 762 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 SPEF1Q9Y4P9 236 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 ACTL7AQ9Y615 435 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 PRRT4C9JH25 899 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 PMM2O15305 246 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 TEX33O43247 280 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 ESRRBO95718 433 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 FGFR4P22455 802 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 GCSHP23434 173 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC6A2P23975 617 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 CD38P28907 300 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 PLA2G5P39877 138 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC6A9P48067 706 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 MPP3Q13368 585 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 SYCE2Q6PIF2 218 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 SEM1Q6ZVN7 128 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 GPR149Q86SP6 731 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 PKNOX2Q96KN3 472 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 MYOCQ99972 504 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 ANLNQ9NQW6 1124 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 FBXO34Q9NWN3 711 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 DNM3Q9UQ16 869 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 INSL6Q9Y581 213 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.512e-11■■■□□ 17.2
RABGGTB-204ENST00000461653 WASHC2AQ641Q2 1341 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 PRSS47A8MTI9 375 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM171A2A8MVW0 826 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 GPR32O75388 356 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 MYBL2P10244 700 aa5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms