RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461648.2

TSC2-208, Transcript of TSC complex subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene TSC2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2-208ENST00000461648 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
TSC2-208ENST00000461648 TAF4BQ92750 862 aa27.39■■□□□ 1.98
TSC2-208ENST00000461648 SEMA4DQ92854 862 aa27.39■■□□□ 1.98
TSC2-208ENST00000461648 IMPG2Q9BZV3 1241 aa27.39■■□□□ 1.98
TSC2-208ENST00000461648 HSD3B7Q9H2F3 369 aa27.39■■□□□ 1.98
TSC2-208ENST00000461648 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
TSC2-208ENST00000461648 RAB20Q9NX57 234 aa27.39■■□□□ 1.98
TSC2-208ENST00000461648 DSEQ9UL01 958 aa27.39■■□□□ 1.98
TSC2-208ENST00000461648 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
TSC2-208ENST00000461648 TRANK1O15050 2925 aa27.39■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 P4HA2O15460 535 aa27.38■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 HUS1O60921 280 aa27.38■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 ASS1P00966 412 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 CYP11A1P05108 521 aa27.38■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 FOSL2P15408 326 aa27.38■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 ZNF18P17022 549 aa27.38■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 PSMD5Q16401 504 aa27.38■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 WDR72Q3MJ13 1102 aa27.38■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 ZNF667Q5HYK9 610 aa27.38■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 ANKS3Q6ZW76 656 aa27.38■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 CCDC150Q8NCX0 1101 aa27.38■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 PI4K2AQ9BTU6 479 aa27.38■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP27.38■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 MYO7AQ13402 2215 aa27.37■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 TNNC1P63316 161 aa27.37■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 CREMQ03060 361 aa27.37■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 CETN1Q12798 172 aa27.37■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa27.37■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 METTL23Q86XA0 190 aa27.37■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 TOP6BLQ8N6T0 577 aa27.37■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 FAM200AQ8TCP9 573 aa27.37■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 ELMO3Q96BJ8 720 aa27.37■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 RXFP1Q9HBX9 757 aa27.37■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 L1RE1Q9UN81 338 aa27.37■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 H7C4K7 107 aa27.36■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 LRRN2O75325 713 aa27.36■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 KRT31Q15323 416 aa27.36■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 VWA3BQ502W6 1294 aa27.36■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 WSCD1Q658N2 575 aa27.36■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 SPOPLQ6IQ16 392 aa27.36■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 LUZP1Q86V48 1076 aa27.36■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 PDCL2Q8N4E4 241 aa27.36■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa27.36■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 PPP2R3CQ969Q6 453 aa27.36■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa27.36■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP27.36■■□□□ 1.972e-6■■■■■ 96.1
TSC2-208ENST00000461648 TAB2Q9NYJ8 693 aa27.36■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 FNIP2Q9P278 1114 aa27.36■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 MTRRQ9UBK8 725 aa27.36■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 POLIQ9UNA4 740 aa27.36■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 OAZ2O95190 189 aa27.35■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 CNPP09543 421 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 NOP14P78316 857 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 SOWAHAQ2M3V2 549 aa27.35■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 TCEAL5Q5H9L2 206 aa27.35■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 MIIPQ5JXC2 388 aa27.35■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 OVOS1Q6IE37 1185 aa27.35■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 ZNF280DQ6N043 979 aa27.35■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 DPH6Q7L8W6 267 aa27.35■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 LIMS2Q7Z4I7 341 aa27.35■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 TMEM86AQ8N2M4 240 aa27.35■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 KLHL5Q96PQ7 755 aa27.35■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 MMS19Q96T76 1030 aa27.35■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 NDST4Q9H3R1 872 aa27.35■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 TLE6Q9H808 572 aa27.35■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 BACE2Q9Y5Z0 518 aa27.35■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 TPM2P07951 284 aa27.34■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 P4HA1P13674 534 aa27.34■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 CTXN3Q4LDR2 81 aa27.34■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 WDR44Q5JSH3 913 aa27.34■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 MICALL1Q8N3F8 863 aa27.34■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 CDH23Q9H251 3354 aa27.34■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 SZT2Q5T011 3432 aa27.34■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 TEX28O15482 410 aa27.33■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 RPL17P18621 184 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 TPM4P67936 248 aa27.33■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 ADGRF2Q8IZF7 708 aa27.33■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 SPATA18Q8TC71 538 aa27.33■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 VPS16Q9H269 839 aa27.33■■□□□ 1.97
TSC2-208ENST00000461648 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa27.32■■□□□ 1.96
TSC2-208ENST00000461648 PES1O00541 588 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
TSC2-208ENST00000461648 PER2O15055 1255 aa27.32■■□□□ 1.96
TSC2-208ENST00000461648 TBC1D4O60343 1298 aa27.32■■□□□ 1.96
TSC2-208ENST00000461648 FAM163BP0C2L3 166 aa27.32■■□□□ 1.96
TSC2-208ENST00000461648 ATP1A3P13637 1013 aa27.32■■□□□ 1.96
TSC2-208ENST00000461648 NRIP1P48552 1158 aa27.32■■□□□ 1.96
TSC2-208ENST00000461648 NDUFV1P49821 464 aa27.32■■□□□ 1.96
TSC2-208ENST00000461648 DUSP6Q16828 381 aa27.32■■□□□ 1.96
TSC2-208ENST00000461648 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa27.32■■□□□ 1.96
TSC2-208ENST00000461648 THEM5Q8N1Q8 247 aa27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms