RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 PIRO00625 290 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 PASD1Q8IV76 773 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 NENFQ9UMX5 172 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 THP07101 528 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 PDE6CP51160 858 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 CLCNKBP51801 687 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 WHAMMQ8TF30 809 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 NME7Q9Y5B8 376 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 F8W810 466 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 ENPP3O14638 875 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 B4GALT3O60512 393 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC172P0C7W6 258 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 ATICP31939 592 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 GATMP50440 423 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 TFAP2BQ92481 460 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 TAF4BQ92750 862 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 CNTN6Q9UQ52 1028 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 ABCB4P21439 1286 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 GNA15P30679 374 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 RAB27AP51159 221 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 GNG11P61952 73 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 C2CD6Q53TS8 623 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 HACE1Q8IYU2 909 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 VWCEQ96DN2 955 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 TOX2Q96NM4 488 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 TBX21Q9UL17 535 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 CCP110O43303 1012 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF132P52740 706 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 TNNC1P63316 161 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 MYO1EQ12965 1108 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 VPS36Q86VN1 386 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 DNAI1Q9UI46 699 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 BUB1O43683 1085 aa22.33■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 CDR2Q01850 454 aa22.33■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 HASPINQ8TF76 798 aa22.33■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 TTC3P53804 2025 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 THAP12O43422 761 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 GALCP54803 685 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 LILRA4P59901 499 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 KIF5AQ12840 1032 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF569Q5MCW4 686 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 CPA5Q8WXQ8 436 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM81BQ96LP2 452 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 I3L4J1 428 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 RAD23BP54727 409 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 DPH6Q7L8W6 267 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF280BQ86YH2 543 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF606Q8WXB4 792 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 HCSTQ9UBK5 93 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 KPNA7A9QM74 516 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 MOCS3O95396 460 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 CLTBP09497 229 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 NDST1P52848 882 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM189BP81408 668 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 CILPO75339 1184 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 FTLP02792 175 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC35F6Q8N357 371 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 PGBD4Q96DM1 585 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 CD19P15391 556 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 CYP3A5P20815 502 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 C12orf29Q8N999 325 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 SEPT8Q92599 483 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 ARHGEF26Q96DR7 871 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 THAP2Q9H0W7 228 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-204ENST00000452765 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms