RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ACRBPQ8NEB7 543 aa16.25■□□□□ 0.19
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TAF3Q5VWG9 929 aa16.21■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DSTYKQ6XUX3 929 aa16.21■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LIMS2Q7Z4I7 341 aa16.21■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 UNC93AQ86WB7 457 aa16.21■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZNF280BQ86YH2 543 aa16.21■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 COLGALT2Q8IYK4 626 aa16.21■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C7orf61Q8IZ16 206 aa16.21■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 OLIG1Q8TAK6 271 aa16.21■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 WHAMMQ8TF30 809 aa16.21■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TMEM176AQ96HP8 235 aa16.21■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SENP8Q96LD8 212 aa16.21■□□□□ 0.19
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