RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CA14Q9ULX7 337 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TENM4Q6N022 2769 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADAMTS20P59510 1910 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GREB1Q4ZG55 1949 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 H3BRJ5 948 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC30A4O14863 429 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SURF6O75683 361 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EOMESO95936 686 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AGR2O95994 175 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GNAI2P04899 355 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UBA7P41226 1012 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GIPRP48546 466 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF165P49910 485 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MTMR1Q13613 665 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MTERF2Q49AM1 385 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHSY3Q70JA7 882 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 REC114Q7Z4M0 266 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDZD3Q86UT5 571 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AACSQ86V21 672 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPTC7Q8NI37 304 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MTMR8Q96EF0 704 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DOCK6Q96HP0 2047 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BTBD6Q96KE9 485 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NECTIN4Q96NY8 510 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPAG5Q96R06 1193 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C16orf70Q9BSU1 422 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MKNK2Q9HBH9 465 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COL20A1Q9P218 1284 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMC3Q9UQE7 1217 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMTNL1A8MU46 457 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 J3KRW8 73 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NMT2O60551 498 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLA2G6O60733 806 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FGF18O76093 207 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SRGAP2BP0DMP2 458 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CPEP16870 476 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SNX16P57768 344 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATP8B2P98198 1209 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ROR1Q01973 937 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MGAT3Q09327 533 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AP3B2Q13367 1082 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TDGQ13569 410 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ELF2Q15723 593 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KLHL10Q6JEL2 608 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DAAM2Q86T65 1068 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TTC30AQ86WT1 665 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UBR7Q8N806 425 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SSH3Q8TE77 659 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NUDT8Q8WV74 236 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RSAD2Q8WXG1 361 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TBC1D5Q92609 795 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TBC1D31Q96DN5 1066 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TCF25Q9BQ70 676 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FOXQ1Q9C009 403 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KCNK12Q9HB15 430 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SETD4Q9NVD3 440 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms