RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428962.2

THBS3-202, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 2

Gene THBS3, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-202ENST00000428962 SHCBP1Q8NEM2 672 aa14.53□□□□□ -0.08
THBS3-202ENST00000428962 ATL2Q8NHH9 583 aa14.53□□□□□ -0.08
THBS3-202ENST00000428962 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
THBS3-202ENST00000428962 TXNRD2Q9NNW7 524 aa14.53□□□□□ -0.08
THBS3-202ENST00000428962 CISHQ9NSE2 258 aa14.53□□□□□ -0.08
THBS3-202ENST00000428962 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.52□□□□□ -0.08
THBS3-202ENST00000428962 CST3P01034 146 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
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THBS3-202ENST00000428962 TXNP10599 105 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
THBS3-202ENST00000428962 RALAP11233 206 aa14.52□□□□□ -0.08
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THBS3-202ENST00000428962 SSR1P43307 286 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
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THBS3-202ENST00000428962 CCNG2Q16589 344 aa14.52□□□□□ -0.08
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THBS3-202ENST00000428962 C2CD6Q53TS8 623 aa14.52□□□□□ -0.08
THBS3-202ENST00000428962 C6orf118Q5T5N4 469 aa14.52□□□□□ -0.08
THBS3-202ENST00000428962 WDR78Q5VTH9 848 aa14.52□□□□□ -0.08
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THBS3-202ENST00000428962 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
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THBS3-202ENST00000428962 RIPK2O43353 540 aa14.52□□□□□ -0.09
THBS3-202ENST00000428962 FAM107AO95990 144 aa14.52□□□□□ -0.09
THBS3-202ENST00000428962 AGTP01019 485 aa14.52□□□□□ -0.09
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THBS3-202ENST00000428962 SLC29A2Q14542 456 aa14.52□□□□□ -0.09
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THBS3-202ENST00000428962 TAS2R40P59535 323 aa14.51□□□□□ -0.09
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THBS3-202ENST00000428962 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
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THBS3-202ENST00000428962 RABEP2Q9H5N1 569 aa14.51□□□□□ -0.09
THBS3-202ENST00000428962 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
THBS3-202ENST00000428962 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
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THBS3-202ENST00000428962 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
THBS3-202ENST00000428962 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
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THBS3-202ENST00000428962 MOGSQ13724 837 aa14.5□□□□□ -0.09
THBS3-202ENST00000428962 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
THBS3-202ENST00000428962 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.5□□□□□ -0.09
THBS3-202ENST00000428962 Q3C1V9 767 aa14.5□□□□□ -0.09
THBS3-202ENST00000428962 CHADLQ6NUI6 762 aa14.5□□□□□ -0.09
THBS3-202ENST00000428962 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.5□□□□□ -0.09
THBS3-202ENST00000428962 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
THBS3-202ENST00000428962 CCDC25Q86WR0 208 aa14.5□□□□□ -0.09
THBS3-202ENST00000428962 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.5□□□□□ -0.09
THBS3-202ENST00000428962 CCT8L2Q96SF2 557 aa14.5□□□□□ -0.09
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