RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428007.1

PAICSP3-201, Transcript of phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, phosphoribosylaminoimidazole succinocarboxamide synthetase pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene PAICSP3, Length 1,168 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAICSP3-201ENST00000428007 CYP11A1P05108 521 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 CTHP32929 405 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 MCM4P33991 863 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 MTHFRP42898 656 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 NRIP1P48552 1158 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 LILRA4P59901 499 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 KCNA1Q09470 495 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 CETN1Q12798 172 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 NR1H3Q13133 447 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 ADAM9Q13443 819 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 KCNC3Q14003 757 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 RAB33AQ14088 237 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 PLPP4Q5VZY2 271 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 JADE1Q6IE81 842 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 SLC8B1Q6J4K2 584 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 ZNF280DQ6N043 979 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 DSTYKQ6XUX3 929 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 KIAA0895Q8NCT3 520 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 CCDC150Q8NCX0 1101 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 CEP295NLQ96MC4 621 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 CEP63Q96MT8 703 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 KLHL5Q96PQ7 755 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 ASB2Q96Q27 587 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 CBWD1Q9BRT8 395 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 SFXN1Q9H9B4 322 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 INTS13Q9NVM9 706 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 GDAP2Q9NXN4 497 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 MYO9BQ13459 2157 aa9.6□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 SZT2Q5T011 3432 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 KPNA7A9QM74 516 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 HUS1O60921 280 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 EPB41P11171 864 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 TNNI1P19237 187 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 NR2F2P24468 414 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 DNAJB1P25685 340 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 ELF1P32519 619 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 TNFSF9P41273 254 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 LHX1P48742 406 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 CYP24A1Q07973 514 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 HYAL1Q12794 435 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 PLD1Q13393 1074 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 C9orf57Q5W0N0 161 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 NELFCDQ8IXH7 590 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 ADSSL1Q8N142 457 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 TOP6BLQ8N6T0 577 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 LEMD2Q8NC56 503 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 ZNF461Q8TAF7 563 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 CGRRF1Q99675 332 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 GPR62Q9BZJ7 368 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 IMPG2Q9BZV3 1241 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 VRTNQ9H8Y1 702 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 CLDND1Q9NY35 253 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 MTRRQ9UBK8 725 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 CD207Q9UJ71 328 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 ZMYM5Q9UJ78 669 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 USP20Q9Y2K6 914 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 NLRC5Q86WI3 1866 aa9.59□□□□□ -0.87
PAICSP3-201ENST00000428007 PMM2O15305 246 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 XYLBO75191 536 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 FGF19O95750 216 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 CNPP09543 421 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 CCNE1P24864 410 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 PCSK1P29120 753 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 CA8P35219 290 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 HOXD13P35453 343 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 SOX11P35716 441 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 CLCN4P51793 760 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 TRPC3Q13507 836 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 PNOCQ13519 176 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 PSMD5Q16401 504 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 PTPRNQ16849 979 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 GLRA4Q5JXX5 417 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 LIN9Q5TKA1 542 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 ANKRD54Q6NXT1 300 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 CEP57Q86XR8 500 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 SMRP1Q8NCR6 262 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 VN1R2Q8NFZ6 395 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms