RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424766.5

PMS1-211, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 3

Gene PMS1, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-211ENST00000424766 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 METTL23Q86XA0 190 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 KLHL5Q96PQ7 755 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 FANCLQ9NW38 375 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 MTRRQ9UBK8 725 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 BACE2Q9Y5Z0 518 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 FSD2A1L4K1 749 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 KCNJ18B7U540 433 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 CNPP09543 421 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 CETN1Q12798 172 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 KCNJ12Q14500 433 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 ZNF699Q32M78 642 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 SPATA18Q8TC71 538 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 RAB20Q9NX57 234 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 NCK2O43639 380 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 TBC1D4O60343 1298 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 C1RP00736 705 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 MAN2A1Q16706 1144 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 DUSP6Q16828 381 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 WSCD1Q658N2 575 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 OVOS1Q6IE37 1185 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 FAXDC2Q96IV6 333 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 CLSTN3Q9BQT9 956 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 TSC2P49815 1807 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 TEX28O15482 410 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 ADH1AP07327 375 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 P4HA1P13674 534 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 KLRC2P26717 231 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 NRIP1P48552 1158 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 NDUFV1P49821 464 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 TNNC1P63316 161 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 MYL7Q01449 175 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 HYAL1Q12794 435 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 IQCB1Q15051 598 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 ZNF280DQ6N043 979 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 SEMA4DQ92854 862 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 MMS19Q96T76 1030 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 L1RE1Q9UN81 338 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 PER2O15055 1255 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 ZNF18P17022 549 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 WDR44Q5JSH3 913 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 OR6C75A6NL08 312 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 BECN2A8MW95 431 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 GABRDO14764 452 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 TACC1O75410 805 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 LHX1P48742 406 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 RAB33AQ14088 237 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 VWA3BQ502W6 1294 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 SLC8B1Q6J4K2 584 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 EFHBQ8N7U6 833 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 SLC22A17Q8WUG5 538 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 NDST4Q9H3R1 872 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 IGFLR1Q9H665 355 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 CBX8Q9HC52 389 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 WARSP23381 471 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
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