RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 OR6C75A6NL08 312 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 CCL16O15467 120 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 ALADP13716 330 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 TNNI1P19237 187 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 HOXA9P31269 272 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 METTL23Q86XA0 190 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 RMND1Q9NWS8 449 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 MAFFQ9ULX9 164 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 PRRG1O14668 218 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 XYLBO75191 536 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 SMC2O95347 1197 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 SEC24AO95486 1093 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 NR3C1P04150 777 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 CPB1P15086 417 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 ADCY1Q08828 1119 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 MYBPC2Q14324 1141 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 WSCD1Q658N2 575 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 TCEAL8Q8IYN2 117 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 GSDMAQ96QA5 445 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 POLIQ9UNA4 740 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 VWA8A3KMH1 1905 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 DCXO43602 365 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 OR4Q2P0C623 313 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 BFSP1Q12934 665 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR17Q13304 367 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF516Q92618 1163 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 SMARCE1Q969G3 411 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 CGRRF1Q99675 332 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 NCOR1O75376 2440 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 KINO60870 393 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 CASP4P49662 377 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 MYO1EQ12965 1108 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 SPATA20Q8TB22 786 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 HPDLQ96IR7 371 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM209Q96SK2 561 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 CLUHO75153 1309 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 PLXNA3P51805 1871 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 HUS1O60921 280 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 POU2F2P09086 479 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 NTHL1P78549 312 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 CEP135Q66GS9 1140 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 OR10T2Q8NGX3 314 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 PGLYRP2Q96PD5 576 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 RTP3Q9BQQ7 232 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-204ENST00000416021 LRG1P02750 347 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 FSHRP23945 695 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 NFIL3Q16649 462 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.228e-7■■□□□ 12.1
SH3BP4-204ENST00000416021 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 VNN2O95498 520 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 PRCPP42785 496 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 UBE2HP62256 183 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 CLDN10P78369 228 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 DUSP4Q13115 394 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 ADAM9Q13443 819 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 MYADMQ96S97 322 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 L1RE1Q9UN81 338 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 INSL5Q9Y5Q6 135 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 PHACTR2O75167 634 aa22.68■■□□□ 1.22
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