RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415600.6

PTPRU-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRU, Length 1,590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-203ENST00000415600 SFR1Q86XK3 245 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-203ENST00000415600 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-203ENST00000415600 FGF14Q92915 247 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-203ENST00000415600 CLIC6Q96NY7 704 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-203ENST00000415600 ACCSQ96QU6 501 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-203ENST00000415600 FIZ1Q96SL8 496 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-203ENST00000415600 CORO1BQ9BR76 489 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-203ENST00000415600 A0A1B0GVL5 298 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 OVOS1Q6IE37 1185 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 PANK2Q9BZ23 570 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 KRBA1A5PL33 1030 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 ECI2O75521 394 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 IL18RAPO95256 599 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 CCDC192P0DO97 292 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 IDEP14735 1019 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 ACOT2P49753 483 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 NDUFA8P51970 172 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 DTWD2Q8NBA8 298 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 ING5Q8WYH8 240 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 ASAH2Q9NR71 780 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 GCNT3O95395 438 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 LILRA4P59901 499 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 MYBPC2Q14324 1141 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 RESP18Q5W5W9 173 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 METTL23Q86XA0 190 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 FAM86C1Q9NVL1 165 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 HPSEQ9Y251 543 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 SIT1Q9Y3P8 196 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 MYMKA6NI61 221 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 SEC24AO95486 1093 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 PFKFB1P16118 471 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 ALDH1A3P47895 512 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 EPHB3P54753 998 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 GPC5P78333 572 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 PRKCQQ04759 706 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 TWF1Q12792 350 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 SHC4Q6S5L8 630 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 KXD1Q9BQD3 176 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 CUEDC2Q9H467 287 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 NFICP08651 508 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 AMPD3Q01432 767 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 GPR17Q13304 367 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 SENP8Q96LD8 212 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 GPR88Q9GZN0 384 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 TMEM206Q9H813 350 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 PI15O43692 258 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 GFRA3O60609 400 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 TAF6P49848 677 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 GUCY2FP51841 1108 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 ELSPBP1Q96BH3 223 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 ZNF560Q96MR9 790 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 TIGD1Q96MW7 591 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 PHOX2BQ99453 314 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 ZFP14Q9HCL3 533 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 PANK4Q9NVE7 773 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 DPP3Q9NY33 737 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 PROB1E7EW31 1015 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 PIRO00625 290 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 PPP1R37O75864 691 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 CEBPBP17676 345 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 PNPLA4P41247 253 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 NBL1P41271 181 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 STARD6P59095 220 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 YIPF1Q9Y548 306 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 ASB3Q9Y575 518 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 ANO9A1A5B4 782 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 ZNF202O95125 648 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 FGF19O95750 216 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 GARTP22102 1010 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 TYRO3Q06418 890 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 SMARCB1Q12824 385 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 ANGPT1Q15389 498 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 SV2CQ496J9 727 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 SLC44A4Q53GD3 710 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 PRSS36Q5K4E3 855 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-203ENST00000415600 ITIH5Q86UX2 942 aa22.08■■□□□ 1.13
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