RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414069.2

SPRN-201, Transcript of shadow of prion protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRN, Length 3,128 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRN-201ENST00000414069 CTNNA2P26232 953 aa22.08■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 CALCOCO2Q13137 446 aa22.08■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 UVRAGQ9P2Y5 699 aa22.08■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 HGSO14964 777 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 CDH8P55286 799 aa22.08■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 PPP2R2AP63151 447 aa22.08■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa22.08■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.07■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 CREB1P16220 341 aa22.07■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 ADCY8P40145 1251 aa22.07■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 SCTRP47872 440 aa22.07■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 LBX2Q6XYB7 198 aa22.07■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 DYNLT1P63172 113 aa22.07■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 GSTA5Q7RTV2 222 aa22.07■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 HVCN1Q96D96 273 aa22.07■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 C12orf42Q96LP6 360 aa22.07■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 PPFIA2O75334 1257 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 SLC8A1P32418 973 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 NAMPTP43490 491 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 OAZ1P54368 228 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 SEC14L1Q92503 715 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 MCEEQ96PE7 176 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 NFASCO94856 1347 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 A0A0B4J269 797 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 FAM187AA6NFU0 413 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 PIAS1O75925 651 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 ARL2P36404 184 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 KYNUQ16719 465 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 SULF1Q8IWU6 871 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 POLIQ9UNA4 740 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 F8VP50 259 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 FAM107AO95990 144 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 ETS1P14921 441 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 ZNF606Q8WXB4 792 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 RAPGEF5Q92565 580 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 PASKQ96RG2 1323 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.06■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 LGR5O75473 907 aa22.05■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.05■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 GLIS1Q8NBF1 620 aa22.05■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 C9orf72Q96LT7 481 aa22.05■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 WDR81Q562E7 1941 aa22.05■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 ANP32DO95626 131 aa22.05■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 HADHBP55084 474 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 NOMO3P69849 1222 aa22.05■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.05■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 KCNT1Q5JUK3 1230 aa22.05■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 C3orf20Q8ND61 904 aa22.05■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 MAMLD1Q13495 774 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 SYCP2LQ5T4T6 812 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 DCUN1D2Q6PH85 259 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 SPATA33Q96N06 139 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 ADCY3O60266 1144 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 DIAPH2O60879 1101 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 ATP6V1G2O95670 118 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 ITGA8P53708 1063 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 TRPC3Q13507 836 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 PCYOX1Q9UHG3 505 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 GGT7Q9UJ14 662 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 IFNB1P01574 187 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 PRKCBP05771 671 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 CHN1P15882 459 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 PLCB3Q01970 1234 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 MON1BQ7L1V2 547 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.04■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 CYP2C8P10632 490 aa22.03■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 ANKRD42Q8N9B4 389 aa22.03■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 GINM1Q9NU53 330 aa22.03■■□□□ 1.12
SPRN-201ENST00000414069 PYGLP06737 847 aa22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms