RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409911.5

LRRTM4-205, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,976 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-205ENST00000409911 SLC17A8Q8NDX2 589 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 CFAP61Q8NHU2 1237 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 PYROXD1Q8WU10 500 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 DYDC2Q96IM9 177 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 CRAMP1Q96RY5 1269 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 FAM117AQ9C073 453 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 IL17RBQ9NRM6 502 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 EHD2Q9NZN4 543 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 CD2APQ9Y5K6 639 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 SLX4Q8IY92 1834 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 KRBA1A5PL33 1030 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 CENPBD1B2RD01 187 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 KLHL2O95198 593 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 IFNAR1P17181 557 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 GTF2H1P32780 548 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 PTGS2P35354 604 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 IARSP41252 1262 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 COPAP53621 1224 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 TROAPQ12815 778 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 SLC35G1Q2M3R5 365 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 KRT71Q3SY84 523 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 CCDC58Q4VC31 144 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 ANGPTL6Q8NI99 470 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 CHMP6Q96FZ7 201 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 MMS19Q96T76 1030 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 CASS4Q9NQ75 786 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 SLC8A2Q9UPR5 921 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 ERVK-11Q9UQG0 969 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 SCN9AQ15858 1988 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 USP17L3A6NCW0 530 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 USP17L4A6NCW7 530 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 BTBD18B2RXH4 712 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 NDC80O14777 642 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 SULT1B1O43704 296 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 ATP2B4P23634 1241 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 CASP14P31944 242 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 RPL9P32969 192 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 ECE1P42892 770 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 GTF2IP78347 998 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 PTK2Q05397 1052 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 POU5F1BQ06416 359 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 DNAJC3Q13217 504 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 NR5A1Q13285 461 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 DSC3Q14574 896 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 LPIN1Q14693 890 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 KCNJ8Q15842 424 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 RTN1Q16799 776 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 RESP18Q5W5W9 173 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 PDXDC2PQ6P474 469 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 FAM83AQ86UY5 434 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 IQCKQ8N0W5 287 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 ESR2Q92731 530 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 CEP95Q96GE4 821 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 SPACA7Q96KW9 195 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 TSNARE1Q96NA8 513 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 MARCH7Q9H992 704 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 DNM3Q9UQ16 869 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 TMEM5Q9Y2B1 443 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 NID2Q14112 1375 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 B8ZZF3 427 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 H7C1D1 291 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 XPOTO43592 962 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 HLA-DRAP01903 254 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 CDH3P22223 829 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 CHRNA5P30532 468 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 MTHFRP42898 656 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRTM4-205ENST00000409911 BTDP43251 543 aa7.11□□□□□ -1.27
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