RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 OAZ2O95190 189 aa32.35■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 HLA-DRAP01903 254 aa32.35■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 CYP11A1P05108 521 aa32.35■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 ATICP31939 592 aa32.35■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa32.35■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 BACE2Q9Y5Z0 518 aa32.35■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 ADAM12O43184 909 aa32.34■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 TBC1D4O60343 1298 aa32.34■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 MXI1P50539 228 aa32.34■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 CREMQ03060 361 aa32.34■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 GLYCTKQ8IVS8 523 aa32.34■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 ELMO3Q96BJ8 720 aa32.34■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 KLRC2P26717 231 aa32.33■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 NDUFV1P49821 464 aa32.33■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 RBM10P98175 930 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 KCNC3Q14003 757 aa32.33■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 COL19A1Q14993 1142 aa32.33■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 WDR72Q3MJ13 1102 aa32.33■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 WSCD1Q658N2 575 aa32.33■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 CREBRFQ8IUR6 639 aa32.33■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 EFHBQ8N7U6 833 aa32.33■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 VRTNQ9H8Y1 702 aa32.33■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 L1RE1Q9UN81 338 aa32.33■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 PLXNA3P51805 1871 aa32.33■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 ARHGEF37A1IGU5 675 aa32.32■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 LINC01565O15544 149 aa32.32■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 LRRN2O75325 713 aa32.32■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 ADH1AP07327 375 aa32.32■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 PIK3CAP42336 1068 aa32.32■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 CTC1Q2NKJ3 1217 aa32.32■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa32.32■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 OVOS1Q6IE37 1185 aa32.32■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 LIMS2Q7Z4I7 341 aa32.32■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 PDCL2Q8N4E4 241 aa32.32■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 VN1R2Q8NFZ6 395 aa32.32■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 DSEQ9UL01 958 aa32.32■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 CDY1Q9Y6F8 540 aa32.32■■■□□ 2.77
PKDCC-202ENST00000401498 BRWD1Q9NSI6 2320 aa32.32■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 H7C4K7 107 aa32.32■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 HUS1O60921 280 aa32.32■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 ADAM15Q13444 863 aa32.32■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 SOWAHAQ2M3V2 549 aa32.32■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa32.32■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF699Q32M78 642 aa32.32■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 CTXN3Q4LDR2 81 aa32.32■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 TOP6BLQ8N6T0 577 aa32.32■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 SLC22A17Q8WUG5 538 aa32.32■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 FBXL5Q9UKA1 691 aa32.32■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP32.32■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa32.32■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 GLP2RO95838 553 aa32.31■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 ASS1P00966 412 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 OR1D2P34982 312 aa32.31■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 FMO5P49326 533 aa32.31■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 CLCN4P51793 760 aa32.31■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF280DQ6N043 979 aa32.31■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 SEMA4DQ92854 862 aa32.31■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 PI4K2AQ9BTU6 479 aa32.31■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 NCK2O43639 380 aa32.3■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 KCNH2Q12809 1159 aa32.3■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 SLC8B1Q6J4K2 584 aa32.3■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 PALB2Q86YC2 1186 aa32.3■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 FAM114A1Q8IWE2 563 aa32.3■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 FBXL13Q8NEE6 735 aa32.3■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 COQ4Q9Y3A0 265 aa32.3■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 MYL5Q02045 173 aa32.29■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 SPOPLQ6IQ16 392 aa32.29■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 LLGL2Q6P1M3 1020 aa32.29■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 DPH6Q7L8W6 267 aa32.29■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 PPFIBP1Q86W92 1011 aa32.29■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 METTL23Q86XA0 190 aa32.29■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 TAF4BQ92750 862 aa32.29■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 MMS19Q96T76 1030 aa32.29■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 RTP3Q9BQQ7 232 aa32.29■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP32.29■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 CLDND1Q9NY35 253 aa32.29■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 POLIQ9UNA4 740 aa32.29■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 EPCAMP16422 314 aa32.28■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 NCAPHQ15003 741 aa32.28■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF667Q5HYK9 610 aa32.28■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 FANCLQ9NW38 375 aa32.28■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 RAB20Q9NX57 234 aa32.28■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 FSD2A1L4K1 749 aa32.28■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 PMM2O15305 246 aa32.28■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 LTBRP36941 435 aa32.28■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 TNNC1P63316 161 aa32.28■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 RAB33AQ14088 237 aa32.28■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 CDKAL1Q5VV42 579 aa32.28■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 LILRA6Q6PI73 481 aa32.28■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa32.28■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM86AQ8N2M4 240 aa32.28■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa32.28■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 BPIFA3Q9BQP9 254 aa32.28■■■□□ 2.76
PKDCC-202ENST00000401498 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms