RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF280DQ6N043 979 aa20.88■□□□□ 0.93
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TRAPPC3-204ENST00000373166 APPL2Q8NEU8 664 aa20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC3-204ENST00000373166 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.88■□□□□ 0.93
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TRAPPC3-204ENST00000373166 ARSHQ5FYA8 562 aa20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP49Q70CQ1 688 aa20.86■□□□□ 0.93
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TRAPPC3-204ENST00000373166 PROZP22891 400 aa20.83■□□□□ 0.93
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TRAPPC3-204ENST00000373166 MYCT1Q8N699 235 aa20.83■□□□□ 0.93
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TRAPPC3-204ENST00000373166 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC38A8A6NNN8 435 aa20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC3-204ENST00000373166 HARSP12081 509 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC3-204ENST00000373166 STAT6P42226 847 aa20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF131P52739 623 aa20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC3-204ENST00000373166 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC3-204ENST00000373166 FCHO2Q0JRZ9 810 aa20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC3-204ENST00000373166 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
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