RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 SUMF1Q8NBK3 374 aa11.26□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 ATRIPQ8WXE1 791 aa11.26□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 ZSWIM3Q96MP5 696 aa11.26□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 ASB16Q96NS5 453 aa11.26□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 ASAH2Q9NR71 780 aa11.26□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 YIPF1Q9Y548 306 aa11.26□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 MYO15AQ9UKN7 3530 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 TTC26A0AVF1 554 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 SHISA7A6NL88 538 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 LACTBL1A8MY62 500 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 H0YCG3 227 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 K7ENM7 598 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 M0QZQ0 153 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 SPTLC1O15269 473 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 MOSPD3O75425 235 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 MICAL2O94851 1124 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 CLTAP09496 248 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 GJB2P29033 226 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 LRPAP1P30533 357 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 VIPR2P41587 438 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 RPS9P46781 194 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 C8orf34Q49A92 452 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM119Q4V9L6 283 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 HAUS6Q7Z4H7 955 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 USP37Q86T82 979 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 GPBP1Q86WP2 473 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 SMARCD2Q92925 531 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 IRF7Q92985 503 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 CLDN23Q96B33 292 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 REEP2Q9BRK0 252 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 ZHX3Q9H4I2 956 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 ZSCAN32Q9NX65 697 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 KCND2Q9NZV8 630 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 TSC2P49815 1807 aa11.25□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 ANK1P16157 1881 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 A0A1W2PRU2 124 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 MAN2B1O00754 1011 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF263O14978 683 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 XPOTO43592 962 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 FAM13AO94988 1023 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 PSMC3P17980 439 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 DUSP4Q13115 394 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 MTAPQ13126 283 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 FZD5Q13467 585 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 RABEP1Q15276 862 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 ZBTB6Q15916 424 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 ARSHQ5FYA8 562 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 MYCT1Q8N699 235 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 LEMD2Q8NC56 503 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 SHKBP1Q8TBC3 707 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 FAM3CQ92520 227 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 CALML4Q96GE6 196 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 CRISPLD1Q9H336 500 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 ODF2LQ9ULJ1 636 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 MAFFQ9ULX9 164 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 PIAS3Q9Y6X2 628 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 NCANO14594 1321 aa11.24□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 OR6C75A6NL08 312 aa11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 HEPACAM2A8MVW5 462 aa11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 PPEF2O14830 753 aa11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 OGTO15294 1046 aa11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 OAZ2O95190 189 aa11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 VNN2O95498 520 aa11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 KRT18P05783 430 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 CYP3A5P20815 502 aa11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 ALDH1A3P47895 512 aa11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 EPHB3P54753 998 aa11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 EPHA5P54756 1037 aa11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 PLD1Q13393 1074 aa11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 KYAT1Q16773 422 aa11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 OVOS1Q6IE37 1185 aa11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 TMC8Q8IU68 726 aa11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 MAP4K3Q8IVH8 894 aa11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 YAF2Q8IY57 180 aa11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 ZBTB44Q8NCP5 570 aa11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 BEST2Q8NFU1 509 aa11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 RASSF8Q8NHQ8 419 aa11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 BORCS6Q96GS4 357 aa11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 TMX3Q96JJ7 454 aa11.23□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM209Q96SK2 561 aa11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms