RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368213.9

PTPRK-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 5,816 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-205ENST00000368213 ITIH6Q6UXX5 1313 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 KDM1AO60341 852 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 TBC1D12O60347 775 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 RHOBTB3O94955 611 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 GPD1P21695 349 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 CASP7P55210 303 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 OCRLQ01968 901 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 PCSK7Q16549 785 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 PDXDC1Q6P996 788 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 SLC12A8A0AV02 714 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 KRT38O76015 456 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 HIST1H2ADP20671 130 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 FMO2Q99518 471 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 HIST1H2AJQ99878 128 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 H2AFJQ9BTM1 129 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 WDCPQ9H6R7 721 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 KCNN4O15554 427 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 TOMM70O94826 608 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 SLC1A1P43005 524 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 ATP1A2P50993 1020 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 GPS1Q13098 491 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 MDH1BQ5I0G3 518 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 MFN1Q8IWA4 741 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 RFFLQ8WZ73 363 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 MKNK1Q9BUB5 465 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 GAKO14976 1311 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 NRCAMQ92823 1304 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 BTBD19C9JJ37 291 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 STK4Q13043 487 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 SPRYD7Q5W111 196 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 CCDC188H7C350 402 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 ZMYND10O75800 440 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 IFNA8P32881 189 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 ORC1Q13415 861 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 FBXO47Q5MNV8 452 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 ANKS3Q6ZW76 656 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 M0QYT0 321 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 MYO1DO94832 1006 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 ACSL3O95573 720 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 MAP3K7CLP57077 242 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 APBA1Q02410 837 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 LAMB3Q13751 1172 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 FAM110CQ1W6H9 321 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 CDY2AQ9Y6F7 541 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 HSPA4LO95757 839 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 MCF2P10911 925 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 LLGL2Q6P1M3 1020 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 RNF135Q8IUD6 432 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 GPATCH11Q8N954 259 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 COPS5Q92905 334 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 CCDC151A5D8V7 595 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 AP3B1O00203 1094 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 P4HA2O15460 535 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 EPHB4P54760 987 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 DPYDQ12882 1025 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 KIF19Q2TAC6 998 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 TREML2Q5T2D2 321 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 HIPK3Q9H422 1215 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 SUN2Q9UH99 717 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 SPDYE5A6NIY4 337 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 GNGT2O14610 69 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 DDHD2O94830 711 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 CXCL8P10145 99 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 SOX10P56693 466 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 CUL2Q13617 745 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 PALB2Q86YC2 1186 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 HS6ST3Q8IZP7 471 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 ADSSL1Q8N142 457 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 PGLYRP2Q96PD5 576 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 RCN2Q14257 317 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 SLC25A41Q8N5S1 370 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 SKA1Q96BD8 255 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 RMDN2Q96LZ7 410 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRK-205ENST00000368213 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms