RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF461Q8TAF7 563 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC127Q96BQ5 260 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 MFSD14AQ96MC6 490 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 RTP3Q9BQQ7 232 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 MUTYHQ9UIF7 546 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 CLUHO75153 1309 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 TNNC2P02585 160 aa16.09■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 ATF2P15336 505 aa16.09■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 PAX3P23760 479 aa16.09■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 HOXA9P31269 272 aa16.09■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 NTHL1P78549 312 aa16.09■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 CYP26C1Q6V0L0 522 aa16.09■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 LRRC52Q8N7C0 313 aa16.09■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 OR10T2Q8NGX3 314 aa16.09■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 SPATA20Q8TB22 786 aa16.09■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF516Q92618 1163 aa16.09■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 FNBP1Q96RU3 617 aa16.09■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 PIDD1Q9HB75 910 aa16.09■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa16.09■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 NR2E1Q9Y466 385 aa16.09■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 DOCK6Q96HP0 2047 aa16.09■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 CALUO43852 315 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 KIF20AO95235 890 aa16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 TNNI1P19237 187 aa16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 PNPLA4P41247 253 aa16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 CDR1P51861 262 aa16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 RBP5P82980 135 aa16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 ADCY1Q08828 1119 aa16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 DUOXA2Q1HG44 320 aa16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 UVSSAQ2YD98 709 aa16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 ZCWPW2Q504Y3 356 aa16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 TPGS2Q68CL5 300 aa16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM174Q8WUU8 243 aa16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 SMARCE1Q969G3 411 aa16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 PGLYRP2Q96PD5 576 aa16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 GSDMAQ96QA5 445 aa16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 CRISPLD1Q9H336 500 aa16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 CYP4F11Q9HBI6 524 aa16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 L1RE1Q9UN81 338 aa16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 POLIQ9UNA4 740 aa16.08■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGEF37A1IGU5 675 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 MTMR11A4FU01 709 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 OR6C75A6NL08 312 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 PI4K2BG5E9Z4 385 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 KINO60870 393 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 CST3P01034 146 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 NR2F2P24468 414 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 ELF1P32519 619 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 PRCPP42785 496 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 DLG4P78352 724 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 MYBPC2Q14324 1141 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 CEP135Q66GS9 1140 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 ISM2Q6H9L7 571 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 OSTM1Q86WC4 334 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 TCEAL8Q8IYN2 117 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 PDCL2Q8N4E4 241 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 PARD3BQ8TEW8 1205 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 MYADMQ96S97 322 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 RMND1Q9NWS8 449 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 DSEQ9UL01 958 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 USTQ9Y2C2 406 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 INSL5Q9Y5Q6 135 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 SNX9Q9Y5X1 595 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 PRRG1O14668 218 aa16.06■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 DCXO43602 365 aa16.06■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 HCRTO43612 131 aa16.06■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 AKAP3O75969 853 aa16.06■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 SMC2O95347 1197 aa16.06■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 POU2F2P09086 479 aa16.06■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 UBE2HP62256 183 aa16.06■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 GPR17Q13304 367 aa16.06■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 NFIL3Q16649 462 aa16.06■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 METTL23Q86XA0 190 aa16.06■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 TTC9BQ8N6N2 239 aa16.06■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 HPDLQ96IR7 371 aa16.06■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa16.06■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 GDAP2Q9NXN4 497 aa16.06■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 MAN1B1Q9UKM7 699 aa16.06■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 YIPF1Q9Y548 306 aa16.06■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 XYLBO75191 536 aa16.05■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 LRG1P02750 347 aa16.05■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 ASGR2P07307 311 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms