RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 MTX3Q5HYI7 312 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 ERO1BQ86YB8 467 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 C7orf57Q8NEG2 295 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 RDH11Q8TC12 318 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 FEM1BQ9UK73 627 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 PRR12Q9ULL5 1215 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 SHOC2Q9UQ13 582 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 LZTS1Q9Y250 596 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 KRT87PA6NCN2 255 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 H3BRJ5 948 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 SNAP91O60641 907 aa5.14□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 C1DQ13901 141 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 GNA13Q14344 377 aa5.14□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 HPS1Q92902 700 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 SEC16BQ96JE7 1060 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 PRDM1O75626 825 aa5.14□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 DPYSQ14117 519 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 NFIXQ14938 502 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 GRAMD1BQ3KR37 738 aa5.14□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 CCDC24Q8N4L8 307 aa5.14□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 CAPN9O14815 690 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 SUPT3HO75486 399 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 SLC2A3P11169 496 aa5.14□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 RAD23AP54725 363 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 LRRC36Q1X8D7 754 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 STRIP1Q5VSL9 837 aa5.14□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 XXYLT1Q8NBI6 393 aa5.14□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 SH3GL2Q99962 352 aa5.14□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 ATICP31939 592 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 AP3S2P59780 193 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 PPIL2Q13356 520 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 PTK2BQ14289 1009 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 KRT72Q14CN4 511 aa5.14□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 ARCQ7LC44 396 aa5.14□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 CYFIP2Q96F07 1278 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 TMX1Q9H3N1 280 aa5.14□□□□□ -1.59
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