RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 E2F7Q96AV8 911 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 SLC34A1Q06495 639 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 STXBP2Q15833 593 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 OR6B2Q6IFH4 312 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 TMC4Q7Z404 712 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 ASZ1Q8WWH4 475 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 FUT8Q9BYC5 575 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 AP3M1Q9Y2T2 418 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 MROH7Q68CQ1 1323 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 FTLP02792 175 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 ATP4AP20648 1035 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 PRCPP42785 496 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 RAP1GAPP47736 663 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 CCT3P49368 545 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 COASYQ13057 564 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 OSCP1Q8WVF1 389 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 NAT9Q9BTE0 207 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 H3BNX3 289 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 SASH1O94885 1247 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 ATP1A4Q13733 1029 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 SLC10A5Q5PT55 438 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 CACHD1Q5VU97 1274 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM270Q6UE05 265 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 SERPINB13Q9UIV8 391 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 SQORQ9Y6N5 450 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF544Q6NX49 715 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 BARGINQ6ZT62 677 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 PAK5Q9P286 719 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.59□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 RPS6KA5O75582 802 aa8.59□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 MFN2O95140 757 aa8.59□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 ALDH1B1P30837 517 aa8.59□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 KRT33BQ14525 404 aa8.59□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 KLHL17Q6TDP4 642 aa8.59□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 OSBPL10Q9BXB5 764 aa8.59□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 PACSIN1Q9BY11 444 aa8.59□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 ATP6V1HQ9UI12 483 aa8.59□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 IQGAP3Q86VI3 1631 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 PTPRKQ15262 1439 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 DDR2Q16832 855 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 JAMLQ86YT9 394 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 FOPNLQ96NB1 174 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 BTBD3Q9Y2F9 522 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 XIAPP98170 497 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 KYQ8NBH2 561 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 C9orf16Q9BUW7 83 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 BTN3A3O00478 584 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF23P17027 643 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 GNA15P30679 374 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 HSD17B4P51659 736 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 DLG4P78352 724 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 PTK6Q13882 451 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 DENND6AQ8IWF6 608 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 DPP10Q8N608 796 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 ZIM3Q96PE6 472 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM79Q9BSE2 394 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 CASS4Q9NQ75 786 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 WARSP23381 471 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 NR1I3Q14994 352 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 LONRF1Q17RB8 773 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 SPDYE7PQ495Y7 208 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 HSPBP1Q9NZL4 362 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 ABCB5Q2M3G0 1257 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 RFX8Q6ZV50 586 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 GCNAQ96QF7 691 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 MCM8Q9UJA3 840 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 TMCO1Q9UM00 188 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 TPRKBQ9Y3C4 175 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 MAP3K19Q56UN5 1328 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 VIL1P09327 827 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 NPR3P17342 541 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 MTFR1Q15390 333 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 SORCS3Q9UPU3 1222 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 MAPRE3Q9UPY8 281 aa8.58□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms