RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317907.8

TTC27-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 27, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC27, Length 2,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27-201ENST00000317907 NENFQ9UMX5 172 aa11.3□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 THAP12O43422 761 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 SPOPO43791 374 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 PSAPP07602 524 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 SFNP31947 248 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 KLC1Q07866 573 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 STXBP2Q15833 593 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 CCDC6Q16204 474 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 LRRC71Q8N4P6 559 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 STK32AQ8WU08 396 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 ZNF516Q92618 1163 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 COPS5Q92905 334 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 LRRC37BQ96QE4 947 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 SYT15Q9BQS2 421 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 TCHPQ9BT92 498 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 TMEM109Q9BVC6 243 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 ZNF408Q9H9D4 720 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 C19orf81C9J6K1 198 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 MAP3K13O43283 966 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 PEX11AO75192 247 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 ENTPD5O75356 428 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 ECEL1O95672 775 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 EDN1P05305 212 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 CFHP08603 1231 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 CCNB1P14635 433 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 HSPA6P17066 643 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 MUTP22033 750 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 EPHB2P29323 1055 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 LIG4P49917 911 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 NCKAP1LP55160 1127 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 POLE2P56282 527 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 DNAJC3Q13217 504 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 CGB2Q6NT52 195 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 ABHD15Q6UXT9 468 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 PASD1Q8IV76 773 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 SLC9A9Q8IVB4 645 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 ASAP3Q8TDY4 903 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 CPA5Q8WXQ8 436 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 ATP6V0A1Q93050 837 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 SGIP1Q9BQI5 828 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 HAPLN2Q9GZV7 340 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 TXNRD2Q9NNW7 524 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 IRAK4Q9NWZ3 460 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 RNF181Q9P0P0 153 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 PCYOX1Q9UHG3 505 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 C2CD2Q9Y426 696 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 ANKRD62A6NC57 917 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 TPBGLP0DKB5 382 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 MAPTP10636 758 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 CHRNB2P17787 502 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 ATP6V1C1P21283 382 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 COMTP21964 271 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 COILP38432 576 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 RFC5P40937 340 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 STRN3Q13033 797 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 CLUL1Q15846 466 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 ZNF394Q53GI3 561 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 ANKLE1Q8NAG6 615 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 FAM13CQ8NE31 585 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 TTC8Q8TAM2 541 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 C1orf54Q8WWF1 131 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 DNAJC9Q8WXX5 260 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 GPRASP2Q96D09 838 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 SERPINB12Q96P63 405 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 ZSWIM1Q9BR11 485 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 FBXO40Q9UH90 709 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 PTPRJQ12913 1337 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 CBX6O95503 412 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 PYGMP11217 842 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 GM2AP17900 193 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 CHKAP35790 457 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 MTFR1Q15390 333 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 HSDL1Q3SXM5 330 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 RNF220Q5VTB9 566 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 KRT39Q6A163 491 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 SULF1Q8IWU6 871 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 ART4Q93070 314 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 ZNF302Q9NR11 478 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 ANKEF1Q9NU02 776 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 RAB20Q9NX57 234 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 PRKAG3Q9UGI9 489 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC27-201ENST00000317907 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms