RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311160.13

TNS3-201, Transcript of tensin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS3, Length 7,618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-201ENST00000311160 USP14P54578 494 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 RDM1Q8NG50 284 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 FAR2Q96K12 515 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 KLHL32Q96NJ5 620 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 ALKBH4Q9NXW9 302 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 ITIH6Q6UXX5 1313 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 TTLL13PA6NNM8 815 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 MPOP05164 745 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 PLA2G4AP47712 749 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 GPC3P51654 580 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 IL2P60568 153 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 DLG1Q12959 904 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 CAMK1DQ8IU85 385 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 SAMD3Q8N6K7 520 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 ETNK1Q9HBU6 452 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 TRIM10Q9UDY6 481 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 CDC23Q9UJX2 597 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 SPTLC1O15269 473 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 JAK2O60674 1132 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 FBLN1P23142 703 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 WARSP23381 471 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 SLC16A2P36021 539 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 KCNK10P57789 538 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 TPI1P60174 286 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 FAM20CQ8IXL6 584 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 DAPK1P53355 1430 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 HEATR9A2RTY3 570 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 A8MXQ7 604 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 GDF11O95390 407 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 PTPN7P35236 360 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 FAM171BQ6P995 826 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP11.16□□□□□ -0.627e-8■■■■■ 32.8
TNS3-201ENST00000311160 ZNF786Q8N393 782 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 PJA1Q8NG27 643 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 PTPRN2Q92932 1015 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 CAMKK2Q96RR4 588 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 CHKBQ9Y259 395 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 ZBTB39O15060 712 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 FGGP02679 453 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 VCLP18206 1134 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 SDC4P31431 198 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 C2CD6Q53TS8 623 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 ENKURQ8TC29 256 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 AIF1LQ9BQI0 150 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 CNPPD1Q9BV87 410 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 TRIM17Q9Y577 477 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 DDHD1Q8NEL9 900 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 ERLEC1Q96DZ1 483 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 KCNS3Q9BQ31 491 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 TPST1O60507 370 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 ZNF432O94892 652 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 IGHDP01880 384 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 CPA3P15088 417 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 PPP2R1BP30154 601 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 SMCO1Q147U7 214 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 OCLNQ16625 522 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 DGKDQ16760 1214 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 GALNTL6Q49A17 601 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 MTSS1LQ765P7 747 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 ARMC7Q9H6L4 198 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 TRIM36Q9NQ86 728 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 WWOXQ9NZC7 414 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 DNAL1Q4LDG9 190 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 PADI6Q6TGC4 694 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 TMEM270Q6UE05 265 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 E2F7Q96AV8 911 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 CLIP3Q96DZ5 547 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 CLIC6Q96NY7 704 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 DSN1Q9H410 356 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 TASP1Q9H6P5 420 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 CDYLQ9Y232 598 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 PLCH2O75038 1416 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 ZNF862O60290 1169 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 PFKFB1P16118 471 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 GSSP48637 474 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 POU4F1Q01851 419 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 DSG1Q02413 1049 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 MFSD14CQ5VZR4 134 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 ADAM33Q9BZ11 813 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 PIF1Q9H611 641 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 GGT7Q9UJ14 662 aa11.15□□□□□ -0.62
TNS3-201ENST00000311160 BTN3A3O00478 584 aa11.15□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms