RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308020.5

PTDSS2-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS2, Length 2,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-201ENST00000308020 H0YCG3 227 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 K7ERI5 159 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 GLRA2P23416 452 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 GNA15P30679 374 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 STX2P32856 288 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 CUL2Q13617 745 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 SPATA21Q7Z572 469 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 KATNAL2Q8IYT4 538 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 MAGEC3Q8TD91 643 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 CDH16O75309 829 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 OATP04181 439 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 NCALDP61601 193 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 P3H1Q32P28 736 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 DLK2Q6UY11 383 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 DEPTORQ8TB45 409 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 TBC1D31Q96DN5 1066 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 LGALS13Q9UHV8 139 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 KRT10P13645 584 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 KCNJ2P63252 427 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 SEZ6Q53EL9 994 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 KAZNQ674X7 775 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 GLIS1Q8NBF1 620 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM212AQ96EL1 285 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.151e-6■□□□□ 11.1
PTDSS2-201ENST00000308020 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 PORCNQ9H237 461 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 ECT2Q9H8V3 914 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 HGSO14964 777 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 TCF4P15884 667 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 KLRC2P26717 231 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 ENPEPQ07075 957 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 EXD1Q8NHP7 514 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 CFAP73A6NFT4 308 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 NF2P35240 595 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 MAGEA4P43358 317 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 GALNTL6Q49A17 601 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 BBOF1Q8ND07 529 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 FBXO40Q9UH90 709 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 MCM8Q9UJA3 840 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC8A1P32418 973 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 NEDD9Q14511 834 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 TMED2Q15363 201 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 TREML2Q5T2D2 321 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 CCDC77Q9BR77 488 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 PNMA3Q9UL41 463 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 RASA4BC9J798 803 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 RASA4O43374 803 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 STAT4Q14765 748 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 CGB2Q6NT52 195 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 TRIM72Q6ZMU5 477 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 FITM2Q8N6M3 262 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 DNPEPQ9ULA0 475 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 ATG7O95352 703 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 POTEJP0CG39 1038 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 EZRP15311 586 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 NAMPTP43490 491 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 RMDN2Q96LZ7 410 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2-201ENST00000308020 EDN1P05305 212 aa22.2■■□□□ 1.14
PTDSS2-201ENST00000308020 NQO1P15559 274 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTDSS2-201ENST00000308020 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTDSS2-201ENST00000308020 ABCD1P33897 745 aa22.2■■□□□ 1.14
PTDSS2-201ENST00000308020 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.2■■□□□ 1.14
PTDSS2-201ENST00000308020 RELL1Q8IUW5 271 aa22.2■■□□□ 1.14
PTDSS2-201ENST00000308020 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTDSS2-201ENST00000308020 DNERQ8NFT8 737 aa22.2■■□□□ 1.14
PTDSS2-201ENST00000308020 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms