RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285243.6

ANKRD40-201, Transcript of ankyrin repeat domain 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD40, Length 4,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40-201ENST00000285243 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 TRIM55Q9BYV6 548 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 VCX3BQ9H321 246 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 YDJCA8MPS7 323 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 TULP2O00295 520 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 SMIM24O75264 130 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 RAP1GAPP47736 663 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 RBP5P82980 135 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 PCNX4Q63HM2 1172 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 TMC3Q7Z5M5 1100 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 HPDLQ96IR7 371 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 ATP5HO75947 161 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 RALAP11233 206 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 DSG3P32926 999 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 MYL6P60660 151 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 CBWD6Q4V339 395 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 FAXCQ5TGI0 409 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 SEMA4AQ9H3S1 761 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 URB1O60287 2271 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 ELF1P32519 619 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 SCTRP47872 440 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 PRPSAP1Q14558 356 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 ARL13BQ3SXY8 428 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 PID1Q7Z2X4 250 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 FBXO41Q8TF61 875 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 KLC2Q9H0B6 622 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 CST8O60676 142 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 LPXNO60711 386 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 KITP10721 976 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 SLC12A1Q13621 1099 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 CDCA5Q96FF9 252 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 SETD4Q9NVD3 440 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 HMBSP08397 361 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 YY1P25490 414 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 PTENP60484 403 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 VGLL4Q14135 290 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 C3orf20Q8ND61 904 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 RAET1EQ8TD07 263 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 GRAMD1AQ96CP6 724 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 OSMRQ99650 979 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 NIF3L1Q9GZT8 377 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 GYG2O15488 501 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 ATP9BO43861 1147 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 GJB6O95452 261 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 CYP11B1P15538 503 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 DLG4P78352 724 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 TRADDQ15628 312 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 P3H1Q32P28 736 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 RASIP1Q5U651 963 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 AGR3Q8TD06 166 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 TIPINQ9BVW5 301 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 VPS11Q9H270 941 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 KIF9Q9HAQ2 790 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 ZFP69BQ9UJL9 534 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 CXCL8P10145 99 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 FECHP22830 423 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 ITGA8P53708 1063 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 TLK1Q9UKI8 766 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 NID2Q14112 1375 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 E2F8A0AVK6 867 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 DIAPH2O60879 1101 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 CPB1P15086 417 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 FAM53CQ9NYF3 392 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 MYBL1P10243 752 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 CETPP11597 493 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 INSRRP14616 1297 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 SLC1A1P43005 524 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 TRIM72Q6ZMU5 477 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 ACOT1Q86TX2 421 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 HDAC11Q96DB2 347 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 TRABDQ9H4I3 376 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 SKIP12755 728 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 CDH8P55286 799 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 C4orf33Q8N1A6 199 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms