RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254190.3

CHSY1-201, Transcript of chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHSY1, Length 4,550 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1-201ENST00000254190 NVLO15381 856 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
CHSY1-201ENST00000254190 EXTL3O43909 919 aa25.2■■□□□ 1.63
CHSY1-201ENST00000254190 NWD1Q149M9 1564 aa25.2■■□□□ 1.63
CHSY1-201ENST00000254190 KCNT1Q5JUK3 1230 aa25.2■■□□□ 1.63
CHSY1-201ENST00000254190 TTC39CQ8N584 583 aa25.2■■□□□ 1.63
CHSY1-201ENST00000254190 ICA1LQ8NDH6 482 aa25.2■■□□□ 1.63
CHSY1-201ENST00000254190 UBA3Q8TBC4 463 aa25.2■■□□□ 1.63
CHSY1-201ENST00000254190 ZBBXA8MT70 800 aa25.2■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 ZBTB7AO95365 584 aa25.2■■□□□ 1.62
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CHSY1-201ENST00000254190 KCNMA1Q12791 1236 aa25.2■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 NIF3L1Q9GZT8 377 aa25.2■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 GZMAP12544 262 aa25.2■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 ELMO3Q96BJ8 720 aa25.2■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 HAUS8Q9BT25 410 aa25.2■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.624e-10■■■■■ 32.9
CHSY1-201ENST00000254190 DEUP1Q05D60 604 aa25.2■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
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CHSY1-201ENST00000254190 TKFCQ3LXA3 575 aa25.19■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 ZNF677Q86XU0 584 aa25.19■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 YY1AP1Q9H869 796 aa25.19■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 WNT7AO00755 349 aa25.19■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 MROH9Q5TGP6 573 aa25.19■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 ABCF3Q9NUQ8 709 aa25.19■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 NPTX2P47972 431 aa25.19■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 PTENP60484 403 aa25.19■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 TTC8Q8TAM2 541 aa25.19■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 MANSC1Q9H8J5 431 aa25.19■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 PHTF1Q9UMS5 762 aa25.19■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.18■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 SPDYE6P0CI01 402 aa25.18■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 MYBL2P10244 700 aa25.18■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 DNAJC9Q8WXX5 260 aa25.18■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 FAM129AQ9BZQ8 928 aa25.18■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 BATF3Q9NR55 127 aa25.18■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 PNMA3Q9UL41 463 aa25.18■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 SIK3Q9Y2K2 1263 aa25.18■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 CUL2Q13617 745 aa25.18■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 KIAA1841Q6NSI8 718 aa25.18■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 ZNF507Q8TCN5 953 aa25.18■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 HAO1Q9UJM8 370 aa25.18■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 ORC6Q9Y5N6 252 aa25.18■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 TRIM49D1C9J1S8 452 aa25.18■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 UBOX5O94941 541 aa25.18■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 FAM111AQ96PZ2 611 aa25.18■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
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CHSY1-201ENST00000254190 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
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CHSY1-201ENST00000254190 SV2AQ7L0J3 742 aa25.17■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.624e-6■■■■■ 48.1
CHSY1-201ENST00000254190 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 ZNF844Q08AG5 666 aa25.17■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 VPS72Q15906 364 aa25.17■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.17■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 SLC5A5Q92911 643 aa25.17■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 RSAD1Q9HA92 442 aa25.17■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa25.17■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 PRAMEP78395 509 aa25.17■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa25.17■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 OLFML3Q9NRN5 406 aa25.17■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 MGEA5O60502 916 aa25.17■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 PPIL6Q8IXY8 311 aa25.17■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa25.17■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 PAK5Q9P286 719 aa25.17■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 L3MBTL1Q9Y468 752 aa25.17■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 ATP8B3O60423 1300 aa25.17■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 KLRC4O43908 158 aa25.16■■□□□ 1.62
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CHSY1-201ENST00000254190 EVX2Q03828 476 aa25.16■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 KCNA1Q09470 495 aa25.16■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 ORC1Q13415 861 aa25.16■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 MMP19Q99542 508 aa25.16■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 FAM86B1E9PN63 330 aa25.16■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 FAM86B2P0C5J1 330 aa25.16■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 TMC3Q7Z5M5 1100 aa25.16■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 MICALL2Q8IY33 904 aa25.16■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 ARHGEF37A1IGU5 675 aa25.15■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 NQO1P15559 274 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 PPCSQ9HAB8 311 aa25.15■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CHSY1-201ENST00000254190 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
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