RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 SPOPO43791 374 aa21.43■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 KCNJ1P48048 391 aa21.43■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 BNIP1Q12981 228 aa21.43■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 SPATA21Q7Z572 469 aa21.43■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 C12orf56Q8IXR9 622 aa21.43■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 KIRREL3Q8IZU9 778 aa21.43■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 FAM212AQ96EL1 285 aa21.43■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa21.43■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 STRNO43815 780 aa21.42■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 ACSL3O95573 720 aa21.42■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 RTP1P59025 263 aa21.42■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 MYBPC2Q14324 1141 aa21.42■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 ANKRD42Q8N9B4 389 aa21.42■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 LMO3Q8TAP4 145 aa21.42■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 KCNK9Q9NPC2 374 aa21.42■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 EXOC7Q9UPT5 735 aa21.42■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 LRRIQ4A6NIV6 560 aa21.42■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 ADRB2P07550 413 aa21.42■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 CCND1P24385 295 aa21.42■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 ADCYAP1R1P41586 468 aa21.42■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 PPP3CAQ08209 521 aa21.42■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 CETN1Q12798 172 aa21.42■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa21.42■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 NEBLO76041 1014 aa21.41■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 MTA2O94776 668 aa21.41■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 ARL2P36404 184 aa21.41■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 VAMP7P51809 220 aa21.41■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 VSTM1Q6UX27 236 aa21.41■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 CD101Q93033 1021 aa21.41■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 GJB6O95452 261 aa21.41■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 GCLMP48507 274 aa21.41■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 FAM110CQ1W6H9 321 aa21.41■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.41■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 CKAP2Q8WWK9 683 aa21.41■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 POMGNT1Q8WZA1 660 aa21.41■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 CCDC127Q96BQ5 260 aa21.41■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 BICD1Q96G01 975 aa21.41■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 FAXDC2Q96IV6 333 aa21.41■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 WHRNQ9P202 907 aa21.41■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 EMSYQ7Z589 1322 aa21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 PLXNB2O15031 1838 aa21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 ZBTB42B2RXF5 422 aa21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 ARHGEF19Q8IW93 802 aa21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 LRRC71Q8N4P6 559 aa21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 RXFP1Q9HBX9 757 aa21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 LGR5O75473 907 aa21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 KRT16P08779 473 aa21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 ABRAQ8N0Z2 381 aa21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 KIF2BQ8N4N8 673 aa21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 TMEM174Q8WUU8 243 aa21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 RNPEPQ9H4A4 650 aa21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 MLXIPLQ9NP71 852 aa21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
VGF-201ENST00000249330 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 CREB1P16220 341 aa21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 RWDD2BP57060 319 aa21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 ARHGAP1Q07960 439 aa21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 GRB14Q14449 540 aa21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 NPLOC4Q8TAT6 608 aa21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 GDAP1Q8TB36 358 aa21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 LRRC19Q9H756 370 aa21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 STK38LQ9Y2H1 464 aa21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 DIAPH2O60879 1101 aa21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 MAFO75444 373 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 KRT17Q04695 432 aa21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 DEPTORQ8TB45 409 aa21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 MAML3Q96JK9 1138 aa21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 NUP85Q9BW27 656 aa21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 KATNBL1Q9H079 304 aa21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 ASIC3Q9UHC3 531 aa21.39■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 EDN1P05305 212 aa21.38■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 DLATP10515 647 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 RFC5P40937 340 aa21.38■■□□□ 1.01
VGF-201ENST00000249330 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms